;; Masterfile modified automatically by mfannot version 1.33
;;    - Gene Totals: 106
;;    - List of genes added:
;;      atp1 (3 introns)     atp6 (1 introns)     atp8                
;;      atp9                 cob (6 introns)      cox1 (11 introns)   
;;      cox3 (3 introns)     nad1                 nad2                
;;      nad3                 nad4 (1 introns)     nad4L               
;;      nad5 (2 introns)     nad7 (6 introns)     orf101              
;;      orf106               orf1086              orf119              
;;      orf1225              orf123               orf132              
;;      orf1472              orf1477              orf148              
;;      orf1486              orf149               orf1493             
;;      orf1510              orf1511              orf158              
;;      orf204               orf223               orf240              
;;      orf241               orf259               orf269              
;;      orf315               orf327               orf353              
;;      orf370               orf385               orf424              
;;      orf451               orf465               orf499              
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;;      orf526               orf550               orf580              
;;      orf589               orf621               orf671              
;;      orf673               orf676               orf688              
;;      orf699               orf734               orf735              
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;;      orf784               rnpB                 rpl14               
;;      rpl16                rpl5                 rpl6                
;;      rps10                rps11                rps12               
;;      rps13                rps14                rps19               
;;      rps3                 rps4                 rps7                
;;      rps8                 rrn5                 trnA(ugc)           
;;      trnC(gca)            trnD(guc)            trnE(uuc)           
;;      trnF(gaa)            trnG(ucc)            trnH(gug)           
;;      trnI(gau)            trnK(uuu)            trnL(uaa)           
;;      trnL(uag)            trnM(cau)            trnN(guu)           
;;      trnP(ugg)            trnQ(uug)            trnR(ucg)           
;;      trnR(ucu)            trnS(gcu)            trnS(uga)           
;;      trnT(ugu)            trnV(uac)            trnW(uca)           
;;      trnY(gua)           
;;
;; end mfannot
;;


>tig00000088 gc=4
     1  GAATTTTAAGTTTATCTAAAATATAGAAAATAAAAATATATTTTTATTTTATGCAGTTTT
    61  TGTATATCATAAATCTTAAGTGTTATTTAACATTTATTTTAGTAAATTTAAGAATAGATT
   121  TTTAAAATAACAAATATAATAATGAACCAGTTATTATTTATAAATTATTTGTAGTAATAA
   181  GATAAATTAACTTTATATTTTAGTTATATAGTTATAATTAGTATAGTATGTATAAATTGG
   241  CATTTATAATATTAGTTACATTAACTATAAAATTAATTTTATATGTTTTTTGATTTTTTC
   301  TAAAAAAATTTGTATCATTTGGAGAAATCTAAGATGAGTTGGTATTAACTAATGATGGTT
   361  ATTGGTTAAAAATA
;     G-atp1 <== end
;     G-atp1-E4 <== end
   375  TTAAAGATTAATTTCAGAGGTAAGCAGAGATTGTAATTTTTTTTTAAGCTCGGGAGAAAT
   435  TTTTTTTTGTTCTTTAATTTCATTTAAAATTTTTGTATGTTTTGTTTTTAAAAGGTTTAA
   495  AAGTTTTTGTTCAAAATTTGATACTTTGTTTGTAGCAATTTTATCTAAAAACCCATTCAT
   555  CCCAGCGAAAATTATAACAACTTGGTATTCAATTGGCATTGGTATGAATTGATTTTGTTT
   615  TAACAATTCGATTAGACGAGAACCTCGATTTAATACGTGTTGTGTAGATGCATCTAAATC
   675  AGACCCGAATTGAGCAAAAGCTTCAACTTCACGGTATTGGGCTAGTTCTAGTTTTAAACC
   735  CCCGGCAACTTGTCTCATTGCTGGAATTTGAGCAGCAGAACCAACACGACTTACTGATAA
   795  ACCCACATTAATTGCGGGCCGAATTCCTTTATAAAAAAGTTCAGCTTCTAGAAAGATTTG
   855  ACCATCTGTAA
;     G-atp1-E4 <== start
;     G-atp1-I3 <== end
   866  aatgggtagataaatattgttaattattatatcccccaatgtaaactgtacatgatagtt
   926  agttatcatacagcttcttttaagagaaaagaattatgtttataaattaaaatatatttt
   986  gataagttataaactacacataattatccagttaggtataattatgtgtagtttattata
  1046  caatttattttattaaaaaataatatttactataaaaacttcccctcacactgttcagtt
  1106  tgattgtttataaaaacaatttttttaagaaaaatgatacagttttcatgccttttttaa
  1166  aaaaaagcttttatttttacaaaaatttgtacttaattttttggaaaaaatatccaatga
  1226  tagctgatatcaaaatttaatattgtttattttggttaaaaagttttaaataaaaattaa
  1286  ttttctattaaaaatagatttttctaaaaaaatttttttttcagtttaatgtttttctat
  1346  aaatgaatttttaatattattatattatgataattaaatatgtataattagataatgtaa
  1406  tttgatgtaaaaattacaagttttcatatataaaattttttaaaaaaaatttcttatcat
  1466  aatttatataattttatacaaattgatgtaattacaaataactgccc
;     G-atp1-I3 <== start /group=II ;; mfannot: splice boundaries uncertain
;     G-atp1-E3 <== end
  1513  TAGAAATAACATTTGTTGGAATATAAGCTGAAACATCTCCAGCTTGTGTTTCTATTATAG
  1573  GAAGCGCGGTTAATGATCCAGCCCCATAGTCTTTATTTAATTTAGCTGCACGTTCTAATA
  1633  AACGAGAATGTAGATAAA
;     G-atp1-E3 <== start
;     G-atp1-I2 <== end
  1651  attgagtcaaaaacttattagtaatgttaattactgttgtatgctcttagagctttacaa
  1711  aataattacttattataaagctctcttttcgttgaaaaattggattttgtgaattattaa
  1771  ttaagtttaatattttttgatgtaaaaaaatatttataaattttatcgaaataaattcat
  1831  attatgaattttataaaattttattgttttataaaattacataaaaagaattgtctgttc
  1891  tatattattttatacaatataaactctagtattaggaactttatgaaaaagttttaaaca
  1951  aaaaaataattatgaatttgtcatatttttgcttgaaatgtttatgaaatacgtcaaaat
  2011  ttctctataactattttttcttagcggtaaagatatgtatatatattaaaaagtttattt
  2071  tatttttgaataaaactttttgacaaacacataaatagttatttatttaaatatacattt
  2131  atgaatatactgtatatttaaaattttttggaaaaaatttacctaattaactaaataccc
;     G-atp1-I2 <== start /group=II(derived)
;     G-atp1-E2 <== end
  2191  AAACGTCTCCGGGATATGCTTCACGACCTGGTGGTCGTCTTAATAGTAAAGACATTTGTC
  2251  TATAAGCTACTGCCTGTTTACTTAAATCATCATAAATGATTAACGCATGCTTTTTATTAT
  2311  CGCGAAAATATTCTCCTATTGTACACCCAGTATATG
;     G-atp1-E2 <== start
;     G-atp1-I1 <== end
  2347  tttggatagaaaaaatttcttccacaaaacttaacgtataaatttctttatattaagctt
  2407  aatgaaaaaatttctagttaaattattaataacctaataaatacatttaatgtagatgtg
  2467  atatacgtctaaaatttggtatttataaattagatttttaaagaaattttttcaaaaact
  2527  gtttttactttaaagtaatttcagattcaaaattataaaattaattataaacttaactag
  2587  tttcttttatactatttataattaaagcgaatttttttagtagataatatttaatttttt
  2647  tgcattgttttatgataatagcaccttttaatcaaaaagtttttatataaatatttataa
  2707  ttgatttgttatataacaaacgtatacatatacttattaatataagtattaaactacctt
  2767  aaatttggggtttagtaatatataaaaagaaacgattgttaaatac
;     G-atp1-I1 <== start /group=II(derived) ;; mfannot: splice boundaries uncertain
;     G-atp1-E1 <== end
  2813  GTGCTAAAAACTGTAATGGAGCGGCTTCAGATGCCGTTGCAGCTACAATGATTGTATATG
  2873  AAAATGCGTTTTCTTTTTCTAATATAGATACTAGTTGAGCAACTGTTGAACGTTTTTGTC
  2933  CGATTGCGACATAA
;     G-orf223 ==> start
  2947  ATGCAGTATAACTTATCGGAATCGTTTAGCTCATTATTTTGATATTTTTGATTTAAAATG
  3007  GTGTCAATTGCAATTGCAGTTTTTCCAGTTTGCCTGTCACCAATGATTAGTTCCCGTTGA
  3067  CCACGTCCAATAGGAACTAAACTGTCAACAGCTTTTAATCCAGTTTGCATTGGCTCAGAA
  3127  ACTGATTTTCTTGGAATAATTCCGGGTGCTTTAACTTCTACCCGCCGAGTTTCATTACTT
  3187  TTAATTGCTCCTTTTCCGTCGATAGGGGCACCTAAAGCGTTAATTGCTCGGCCTAAAAGG
  3247  TCTGTACCTACAGGCACACTAACAATATTTTTAGTACGTTTTACGGATTCTCCTTCTGAA
  3307  ACAAATTTGTCGTTTCCAAAAATAACAATTCCTGCATTATCATTTTCTAAATTTAGAGCC
  3367  ATTCCTTTTAAACCGGAACTAAATTCGACCATTTCACCAGCTTTTAAATTTTGTAATCCA
  3427  AAAACTCGAGCAATTCCGTCTCCTACAGTTAATACTTTTCCTTTTTCAGTGAAGGAATTT
  3487  TTATTAATTCCTGTTGTTGCTATTTGAATTTCTAATAATTGAGATAATTCGTTTATATGT
  3547  AGTTTTTGCAT
;     G-atp1-E1 <== start
;     G-atp1 <== start
  3558  TTCTGCTATAAGTTTTGTATTAAAATTTAAAGTATTTTTTTGTATAATTTTTTTTAACTA
  3618  A
;     G-orf223 ==> end
  3619  AACCGCTAATTTGATAAAAAATTGTTAAGAAATTTATTCATAAAATCTAGAAAACTAAAA
  3679  GAATTTTCCAGTAAAGGAAAAAGTTATTTAATATAAAATTTTTTACATATTAAAAATAAT
  3739  AATATAATTTATATTTTATTTAATTTTTAAGATTTTAAAATTAATGATCCTTTTTTAAAA
  3799  AATGTAGAATTTTATTAAAAATTGAATATCCCATAAACTTATGGTTTATGGGATAATTTT
  3859  CTTACCCATGAAAAATAAGTTTTTAACTTAATCAAAATATTAATATATAATATTTATATA
  3919  TTTTTCATGTAAGTGAACACTAGTCAAGT
;     G-cox3 <== end
;     G-cox3-E4 <== end
  3948  TTAAGCTTTATTTCCCCATATATATATGGAAATGAATAAAAAAAGTCAAACAACATATA
;     G-cox3-E4 <== start
;     G-cox3-I3 <== end
  4007  aacttaaaaatatgcttttttagattttgatttttgcgcatattaatagtttttgaacca
  4067  aacgtaataatttcttattattaggctcttatacaaattaaatatttgtctttatactgt
  4127  atatgtttaatcgtgtagtataaaaaattgcaggaggtaggtaattaaattttaattttt
  4187  ttaaaaaaacatatttaatttgtttagaaggtgttctaatcatttttaaatttctaaaaa
  4247  agaaaagaatatcagcatcaataaacataattatataaatataattatgtttttgctaaa
  4307  atttttgttaagtgtacagtaatatgttttaaactttctaaaagaaagtattttacataa
  4367  gttttattttattctatttgttaaaaatgaattttttttttgaaaaacgtataattagaa
  4427  gtctttaaaagagattttggcttaaaaagtcaatttcaatataatgttgaatttttgatc
  4487  tttttaaagcaacttctatctaattaagaaaaaggacctaactataaatttataagcaca
  4547  caccaacaaaatatattaatcgatatgctttgaagcaataagcgttaattcacacatggc
  4607  gtgcaaattgctaaacaccatgcgttttttatgaaatactttaaatttaaaaaatttttt
  4667  ttcataaataagatacttttaaagcgaagtatcttgcaatactaatttagtgtattagta
  4727  aaataatgctttacattttttttaatttaaaaatctgtttttagattagagtaaattttt
  4787  tggttaaagaagaaatatattggctataatattttttctttaaaaactttggtgtaaaaa
  4847  atatattaaaaacagtatactatatttttatataaaagtattatatattcaaatgcaaag
  4907  aaatat
;     G-cox3-I3 <== start /group=II(derived) ;; mfannot: splice boundaries uncertain
;     G-cox3-E3 <== end
  4913  TCGCCCGCCAATATCATGCTGCTGCTTCGAAAGCAAAATGATGATTATCCGTAAAATGAT
  4973  GTTTTATTAAACGTATTAAACAAATACCCAAAAAAATACTTCCTATTAAAA
;     G-cox3-E3 <== start
;     G-cox3-I2 <== end
  5024  tttgagattaattataaattattaattttctcttagaactgtacatataattttattata
  5084  tacggctcaacataataaattgttattgtgcatacaaaattgatggaattagtattatgc
  5144  aatacatttttattataaatagtgtagtacttaagaattcctattatagggaagcgtagt
  5204  aaatattataaaatttttttgttataatactgttgtttactattttcatatttcattttt
  5264  ttatttaaaaaaaaatgaaaaagtttataatgcatatttgtttttttaaatgcaaattta
  5324  gatatttattattgttataatttttaatatcaaaaatgcaataaaatttgtttgtattag
  5384  aattttcatgtcaaaagaaatatttacaactttaaaaaatatactaaaatatttttatta
  5444  aacaaatacaataaaaaccgtac
;     G-cox3-I2 <== start /group=II(derived)
;     G-cox3-E2 <== end
  5467  CATGAAATCCGTGAAAACCTGTTGCTAAATAAAAAGTTGAACCATAAATACTATCTGAAA
  5527  TATCAAAATCAGCATTTCAATATTCGAAAATCTGTAAAGTAGTAAATATAAATGCTAATA
  5587  TTACTGTCAACAGTAAGCTAATTATAGCTTCTTCTCTAAACCTTTTTAAAATAGTATGAT
  5647  GGCACCACGTTACGCTGCATCCAGATAATAATAAAATTCCAGTGTTTAAAGCAGGCACAT
  5707  ATTTAGCGCTTAAAGAAAAAATACCAAGAGGGGGCCATTTAGTGCCAAGTTCAATAATTG
  5767  GGGCAAAGCTTGAAGTG
;     G-cox3-E2 <== start
;     G-cox3-I1 <== end
  5784  catcaaataatattaattagttatttgtgctcaaaaccgtatgaacttattgtactaagt
  5844  attacggctcccaggaaaaaacaacgtttttaaaa
;     G-cox3-I1-orf673 <== end
  5879  ttaattaatatgcctgatgcggtattctatatctttaatgcgtaattgttttacattacc
  5939  gcattgtactattcctttttttgagaaaaagttctgatatatataataacgaagttgtgg
  5999  ttttgatccaaactttgtaattaaataattaagaaaatagcaagaagataaaaaatcaaa
  6059  ttgctttaattggaaaacaatagttttacttagaccaaaatatataataactttaattaa
  6119  ccattgattatatttttgaattaaaacgtttagtggtaattttaattgtattggggcaaa
  6179  tatatttctaagatcttctttaaggttagaaaaagttttagagcatatagtaatagttat
  6239  attattgtaataattaaataaaatttttctataaaagaaattttcttgatttagatatct
  6299  agtgcattgaatttttcgattaaacatattagtaaacttaaaacctaaatattcaaaaaa
  6359  catatttggatataatatttgtattgaagttacgtttttatctacttgaataaatttttt
  6419  ttttaaaaaaatcaataatcgataataaattattaaaaaatatgaaaaattagcagtaaa
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  6539  taaaataagtgtactctgttgataatttttatttaaaaaacaattagaacggtcatttaa
  6599  tttttcggttaatttaaatgttaacggtaacaatacaaatgattccatattatttaacat
  6659  aacatttgcaattaatgcacccaaaattgtatttcataattttttaatatgtaatgtatt
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  6779  ggagcggtatttgttacaaatgggcatatgttttgccatgacaagataagaattcatatt
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  7859  accaaaaaattttataagtttttttccatgaaaaatatacat
;     G-cox3-I1-orf673 <== start
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  7961  tttttttattagattctgtctgaattaagaatacaaatgatgtatgtttacataacataa
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  8321  cgacaaattcagagtatacccatgg
;     G-cox3-I1 <== start ;; mfannot: no intron type identified
;     G-cox3-E1 <== end
  8346  AAAAAGGCTCAAAAAAAAGCAAAAAAAAATAAAACTTCTGAAAGAATGAAAAGCGCCATT
  8406  CCAAAACTCAAACCAGTCTGTACTATTTGTGTATGCTGACCTTCGAAAGTTGATTCACGG
  8466  ATTACATCTCGCCATCAACATGTAATGCAAAAAATTATTGCGATTAACCCAAAAAGAACA
  8526  AACATATTACTATATTTATACGAATGCAAATAACTTACAAATCCACTTGTAAAAATTCAG
  8586  GCAGCGCAAGCCGTGAAAATTGGCCATGGGCTAGAATCCACTAAATGAAAACCATGAGTA
  8646  CATGTTAAAATTTTTTTTTTTAAAGATTTTAATAACAC
;     G-cox3-E1 <== start
;     G-cox3 <== start
  8684  TTAAATCCAAGTTTTATTACAAATTTTTACAACAATTGTTAGTTGACCTAAACTATTATG
  8744  A
;; mfannot:
  8745  tccctaattcgaaactatgcgtggtattttctaccacatagctt
;; mfannot:     /group=II
  8789  CTTTATTGTAAGTAAAACTCTCCTACTTAATGTACCATTATTACTTACAATAATAAACAA
  8849  ACTTTGCATAGTATTGCTTAATCCATTCTTTTAATATTGATACAATTTCGCTTAATTTTT
  8909  CATGTTTTAAAATTTTAAACTTAGGATTTATATTTTATACCAAATAGATTTTTTCTTTAT
  8969  TTATACTTATGTTTTACGACATAAATACTATCTCTAATAAATAAATTTAAAAAATTTTTT
  9029  TTAAAGTAAATCAATAATAATAATTTAAAATTTATCCATTTTCAAAATATTAATATTGTA
  9089  GCAAATACATTAAATTTTGTTAAAACCTAATATATTTACTACAAATAATTAATTCTACTA
  9149  ATTACAGATTATCATTATTAATTAAAAATATAAAAACTAATATGTAACCTTTTATAGAAA
  9209  TAACAAAATACTAGAAAAATTTTATAAAATTAGCCTACTACATAAAATACTCAATTTATT
  9269  TGATAATAGTTTTGAATTAGAAT
;;     G-nad9 <== end
  9292  TTATAA
;;     G-nad9 <== end
  9298  AAAATCGAAATCCCGATACTCTTGAGCCATTTCTAAGGATTCAGTTAAAATACGTTTTTG
  9358  ATTTTCATCATACCGTACCTCAACATATCCACTTAAAGGAAAATCTTTCCGAAAAGGATG
  9418  TCCATCGGTAGGATA
;;     G-nad9 <== start ;; 138,182
  9433  GGAAATTCTATA
;; mfannot:
  9445  aaccctccactaaaaccacgcatacaatttatattataagtggctt
;; mfannot:     /group=II(derived)
  9491  TCGTTAAATTTACTTTTTTCAATCAAAAAATTTCTATAAAATTTATAAACAGTATATACT
  9551  GTTTCCATTTTTTGGAAAAAAAGTAATTTAAACTTTTATCAAATTATACTCTAAATGATT
  9611  ACTCCAATTCGTACACAATAATTTATATTATCTAGTAAAAACGAATCCATATTTCAAATT
  9671  TAATATTTTTTGTTTTCAATATTTTTATATTAATTTAGTATAAAAAACAGGAAAACTAAT
  9731  AAATACCTTTTTTTGATTAAAAACTTATTATAAACTATAGAAACTAGTCTCTGTTTTCCT
  9791  TTTTAACATAAAAATGTTATTATTTAATCATTATACAGCAAATTCACAAACTATTATTGT
  9851  ATTTATATTTTATTAAAACCCATTTTAGCCAATTATCCTTTTATATTAAATAATATTATA
  9911  TATTTTTATTTAACTGTATTTATTAAGAATAAATAGGGAATAATAATTAAATTTTTAAAA
;;     G-nad9 <== end
  9971  ATGGCTAACAAAACCGTAATCTGTTAGAATACGTCGTAAGTCAAAATTATTTATAAAAAA
 10031  AATACCAAACATATCCCACACTTCCCTTTCAAATCAAACTGCTGCTGGATAAATTAATGA
 10091  GATTGAATTAATTGTTGCTAATAAAGTTAAATTACTTTTTAAAAAAAATCTAGAATTTCG
 10151  GGATATACTTAAAAAATTATATATAATCTCAAAACGTTTTAATTTTGAAAGATAATCTAC
 10211  AGCAATAATATCAATTAAAATTTTATATTGTGTAAGTGTATGATTTTTTAAAAAAATAGA
 10271  AATGGGTTGGATAAATTCGTTTCAAACCCCCATGGCTATAATTTTTCTGTTTACGCATAC
 10331  AGAAATAATTCCACGCAAACAAGACTTTACTATATTTAAAGTATACTTTTCTAT
;;     G-nad9 <== start ;; 6,143
 10385  TAATTTATGTAATTGTCCAACTTTCAAAACTTTTTCCAT
;;     G-nad9 <== start
 10424  CGTTT
;;     G-cox2 <== end
 10429  TTAAATTAATTCTCCATTTGAATC
;;     G-cox2 <== end
 10453  TTCAACATATTTGAAGAAAATTCAAGATACATATTCTTTAAAAGGTACAGCTTCAAGCGC
 10513  AATTGGCATAAATCCATGATTAATACCACTTAG
;;     G-cox2 <== start ;; 238,268
 10546  GTAGATATTATATAAAAATAATTA
;; mfannot:
 10570  cccctaattgaacttaacaagcgcttctcaacgcattaagctc
;; mfannot:     /group=II
 10613  GATTTCAATCTAAAATCTTAGTGACGAAATTTCACAATATTTTTTATATATTTATCTTTT
 10673  GGGACATTGTATTTATTTTTACAAAAATAATTTAGTCATAATAAACATATAAACAGACTA
 10733  TATCTAAAAAAAAAATATTCTATGTAAAATTTAAAAAATATATTAAAGAAAGATGTACAG
 10793  TTTTTAAAAATATTTAGTTATCTAAGATTTTCCAAACTGTATCTTATTCACTTATAATCT
 10853  TAATATTAAAATAAAAGCAAAAAGAAATATCTTAATACATTTTTATAATATTAAAATTTT
 10913  AAATGAAATTTTTATAGCTACATTTATTACTAAAATTAGTATATAATTTATATATCACAG
 10973  TATTCCCAACATCTGTAATTTCAACTGAAAAAACTTACTCAATAAATACAATCTGATATA
 11033  TATTTATTTTTTAGAAAATATTTACGTAAATTTGATAAAATTTTAACTGTTGGCTCTAAA
 11093  GTTTTATAGATTTCCCAAAGCTAGTGCACTATAATATTTTTATATTACACATAGGAAATC
 11153  GACTTGTTTCTTTTCTAAACAAAAATTTAATAAATTAACTATACCGCCA
;;     G-cox2 <== end
 11202  ACAGATCTCACTACACTGGCCATAATAAACACCAGGACGATCGATAAAAACTAGCACTTG
 11262  ATTTAATCTACCAGGACATGCATCGATTTTAATGCCTAACGAAGGTAATGCTCAACTATG
 11322  TAAAACATCAGTTGACGTTACAATCGCACGGATATTTGTATATATAGGTAAAATAATTCG
 11382  TTTATCTACTTCTAATAATCGAAAACTCCCTTCTTGTAAATCATCATCCCCTATAAGGTA
 11442  ACTATCAAATAAGAACGATACATCTGTTGGTAAATTAACCACTGTATAATCTGAATACTC
 11502  ATAACTTCACTGCCAATA
;;     G-cox2 <== start ;; 137,239
 11520  AGTAATTTCACAAGGAA
;; mfannot:
 11537  ttttctttggcaagaaccgtacaagcgttttgcaacgcatacggctc
;; mfannot:     /group=II(derived)
 11584  TAGTAAATTTCTACGTAAACGTATAAACACATAAAATAGGAATTATAATTTGCAGACTGT
 11644  ATTATTTTTTTAAATTAATAACTACTAACTCTGAAAAAATTTTCAATATAATAATCATAT
 11704  TTTTTTTGAAAAATTTGAAATATACCTTAAGCTCTATACGTATTTGATAAATTCATACTG
 11764  ATTTATATGGCAAAAAAAATTCAAATTTTCTGAAAAAACACTGAATTTTAAAAACATATT
 11824  TTTATAAAAGAATTTTAATAAAAAATTAATATTATTTTCATTAAACAAAATAAATACAAT
 11884  TTTGAAGATTATAAACTATAAAGGCATTTATTTAAAATTTTTTCAAAAAACTAATATTAA
 11944  TTTTATATTAAATTTTTTTTTCCTTCAAAAAATCGAATTCATTTTACTTTGTAAAAAAAT
 12004  ATTTTTTTCTAAATATTTTTTCTGCTAAATCAATCCTCCTATTATTATTTTTATCTAAAA
 12064  ATAAAATACAATTATAAATAATTATTTCTACTTAAAAATAGAATATAACTTACTCTCTGA
 12124  ACTACCATAACCTACTTATGCAGATTTTTTTAGCTATTAACCTTTTTGTAAATTTTTTAA
 12184  TTATACTAAAAACACGTACGTTATTTTCAAACTAAATAAAATTTCTTTAGTGTCTAATTT
 12244  ACCAGAAATAACAAATTTCTTTTCATAAATTTGACCATTTCATCGTAATCTTAAACTTAA
 12304  TTTTTTATAAGACTATAAGTTTAAATTATAAAAAATTATAATATTAAGCTTAAGAAAAAC
 12364  TCAACTTCTATCCTAAAATACTTATATCGAATTCAATAAATACCTATGGTTTCAACAAAG
 12424  TAAAATTAAACTTTGTTTTTAATCTTTTGTACATTATTTTTGTACGAAATTATATTCATT
 12484  TCTTACATAAAGATATACTTATACACCGACCAATCAATACTTTTAATTTTATTATCACCT
 12544  TCGAACAAAAAACTTGTGTTTAAGGATTTTAATTTAATAATACAACCAATTTACTTACTA
 12604  CATTTAAACTTTTAATTCTATTATTAAATAACTCAAGCATAAGAATACGTATTAATACGA
 12664  CATTAACGTAAACCCTTATTCAAAAACTTTGAAACCTTATACATGTATTACGTATTTTCT
 12724  ATAATTTAGAAAATTTAATGAATTTCCCACTC
;;     G-cox2 <== end
 12756  ATACCATTGGTGACCAATAACCTTTAAAGTTAGAACTGGATCTATAATTTCATCTATTGA
 12816  ATAAAGTATAGCTAAAGAAGAACTCATCACTCCTACTAAAAGTAACGCAGGTATTAAAAC
 12876  CCATAAAAACTCTAATATCATAATAACCCGATCTGACATATGTCATTCAGTTGTTCTAGG
 12936  GCTTGTAACATCATATTGCTTAGCTATACAAAATAAAATCCACATAACAATTCCTAAAAT
 12996  TAAAAATGCTATGAAAAATAAATCTTGGTACAGTGTAACAATACCATCCATAATAGGAGA
 13056  TGCAGAATCTTGAAATTCAACTTGCCAATTTTCAGCAGAATCAGCAAATAACTCATACCG
 13116  AAAAAGATCCAAAAAAAATATAAATATTAATATAAAATTAAAATT
;;     G-cox2 <== start ;; 10,139
 13161  ACGAAAAAACGAACTTTTTAATAAACACAT
;;     G-cox2 <== start
 13191  AGAACACATAGATATCATATTTTTATGCTTTATACACAAACCCTAAAGTTTTTCTCTCTT
 13251  CAAATTTTTTACCAGACGTTAAAGTTTTATAAACAAGGACAAAAAATACTATTAACGAAA
 13311  TTACTGAAATATATGAACCTAGTGACGCAACTCAATTTCAATGAATAAACGCATCAGGAT
 13371  AATAGTACACTAGTCTAAATAAACCGTGCCCAAAACCGTATAAACTTATTATGCTAAGAA
 13431  TTACGGCTTCGAAGAAAGTAAAATTTAACATTTCTACCGTTATACGATAAATATATATGT
 13491  TTATTATATTAATTATATCAAAAATTATATACTATTATTTAATAACTATTTTTTATAATT
 13551  TTAACATCCGAAGTTATCCTGTATTATTAATTTAATAATATAAC
;     G-orf621 <== end
 13595  TTATACTAAATTAATTTTAATAAATCTACTATAAGTAGATAAATATCGATATATATACGT
 13655  ACGTATTTTAGATACTGAATTATATTTTTTATACAAAAATTTTAAAATTCTTTTATAAAG
 13715  AATATAACTTAAAATTATTAACTGCCTATGTAGACTCTCAAAATAACGATAATATTGTAA
 13775  TATTTTACTCATAAACCTATTTACTTCATTTACAAGAATTTTTAAATTGAGTAATAGATT
 13835  CTTACAAGAAAATAACTGTAAAATCAATCTTCTAACCCGGTTAAAAAAATTTATATTCAA
 13895  TGAAACAGTCCACTTACTCAAAATTTTTTCATAAAAAGATAAATAATTTTTACATATTAT
 13955  AAAATTTTTAAAATTATATTCATTATTTTTAAAAAAAATGCTATTCAAACAATTAAACTT
 14015  CAATCCTGATAAATTCAACGTTGCATTTGGCCTACAATATTTAAATTTCACTATATTTGA
 14075  GCAATTTAACACACTTAATCCACATTTTATCAAAAATTTCACAAAAAATTCATAAAATCG
 14135  AATAAAATATTTACAACTTTTTTTTCCAAAAATTAAAAGTCTACCAGAATAATATACTAT
 14195  TTGTACCATTTGTCGATACTTCATTAATTCTAAATATAAATTACTCTTCTTTAACTCTAA
 14255  ACCACCGTTACTATTAGTAGTAATTTCTCTTGTGAATAAAAAAAATTCAAATAAAATAAA
 14315  TAAAAAAAAACTTAATAAACTTCTTAAAAATACATTTCACAGCATTTCATATTCAAAATG
 14375  CACTCCTGCGGCCTTCAATAAAACTTTATTAACATGGTTAAAAGCAAATGCACCAACTCA
 14435  AATTTTCGATAAAAAAAAATATTTTTTGCAAACTAGTATATTCTCCATAATAGGTAGACA
 14495  AGATATAAAACCCAAATATCTATTAATATTAATATCAATATATTTAGAAAAAGTCATAAT
 14555  ACCACTTATAATTAAACGTTTTCTCCGAACAGATAAATATCAAAATCAAAACTTATAACT
 14615  AATTTTACTTTGCCCAGTAGTTTTTTCGTGTAAAAAATTGTTAGAATTAACAAAAAAATA
 14675  TGAAATATTACAATTTCTTAAATAAAACAAATCCATATCATTAGACATGATACAGTTTGC
 14735  TAATTTTATATAACTTGGTATTAAATTATTTTTTTGTAAGTCTAAAACCTTACCTAAATT
 14795  TAAACAAATTCGAGAATACTCTAAATAGGGACGTAAAGAAAAACCAAAAATCTTTTGCAT
 14855  AATACAATCTTTTAATATAAATAAATAAATAATACAAAATTTCCTAAAATCGTATCTAAA
 14915  ATTAATAAGAGTTTCTTTAAAAGAAATTAACTTATAATAACATAAATAATACTTACAACT
 14975  ACAAATTAAACTTAACAACTGCAAACATCAATAATTAACTTTTTTAAATTTGATTAAAAG
 15035  ACAAATGAATTTTTTTTTTATACTATAGATTTTTTTTGGAAAATCTTGCCTTAACCTAAT
 15095  ATTTTTTTTAGATTTACCATATTTAGTTGTACTCAAAAATTTTTCTAAAAGACTTTTATT
 15155  ATAAACATTCTTAGAAGATAAAAATATAATATTTTTATTACCCATTACTTCACTAAGTGG
 15215  AAGTAACTGCGTATATCAAATTAAATACATTCGTACACTGAATGATTCCATAAATATAAT
 15275  TTGCATTATCACAAAAAATGTAGGTAATTTGAAACTTCCAAAATAATTAAGATTAGCCCC
 15335  ACCATATATTAACATCATTTTAAATACAACATGATTATAAAAAATAATTAAACTTTCTAA
 15395  TTTCAAAATTATCTCTATTTTAAATAAATTCGTATCTTTTCGTAGAAAAATATATCGTAA
 15455  CCGCAT
;     G-orf621 <== start
 15461  ATCTACTATATGACAGCATCTAACTCAATACCTTAATAAATTAAAACTTTCTTTACAACT
 15521  AATAATATCTTTTTTTAAAACCTACCATTCTACGATAGTGCTTCAATTAACATTTTTAGC
 15581  TATTCTATCTGAAAAAAATTACAATAATTAACAAAAATCTTACCTAATCACAAATAATTT
 15641  TGCAAATTAAATATAACATTGGTATATACATAACAATAAAACTAACTTTTATCAATTTTT
 15701  TATACACGTCAACTTAACTGTAAACTATCCAATCGAAAACAGTACTTATCTTAATAAAAA
 15761  ATTTATAATATACTATTCTTATACATTACCATTATTTTAAGTATATTTGCTTGATTTAAG
 15821  GTATTATAATTATCTTCATA
;     G-cox1 <== end
;     G-cox1-E12 <== end
 15841  TTATCTACAATAAGAAAATAAATCAAGCTCGTTAACAATTTTTTTAATTTCAGACTTTAC
 15901  TCCTGGAATTCGTCTTGGCATTCCGGCTAAACCTAAAGCATGCATTGGAAAAAAAGTTAT
 15961  ATTTACACCAAAAAAAAATGTTCAAAAATGTATTTTACCTAATCTTTCAGGATATTTATA
 16021  TCCACTAATTTTACCAATTCATAAATAAAATCCGGCAAATA
;     G-cox1-E12 <== start
;     G-cox1-I11 <== end
 16062  ctccacaaagaatagaatttttaaaaacaaatccttctaaaaaactgcacatacaactta
 16122  attttgtatacagcttatttttataactaataaggcactatattatccattaaaaaatat
 16182  aaaataaatttaattaagtactttacttaacacttttattttattaagtttatcgattta
 16242  tactaaatttataattttaaaactaaccttttttctatttacctgtgcttatattaatta
 16302  ataaaaatatattaaaataataactacatatattcaataatctttcctttttaaaaaagt
 16362  ataacctaacgtattaatacaactatgttactaataaaaagctcctgtaatcctattgaa
 16422  ttaatttttttgtttactacaaataaaaatatgaataaaaatgaatttatatatttctag
 16482  attataatattataatatgtttacttataatttcaaagaatttactttatatagttatta
 16542  ttcaaaaaacaaagcaaatcttcaatacatactaaaatatactgaaatacattaaaattc
 16602  ttaaacgtaaaatttttacctttttcatatttaattgaattctatgattttacgctaaaa
 16662  tatatacatataaaccttataaaaaaattatcatatatgcacacgtccatctcttataaa
 16722  ttttttattaacttgttaaacatagatacatatattcaaaaattctactattcaaatact
 16782  tttttcaaaatcattattaacatccaattgattttaggt
;     G-cox1-I11 <== start /group=II(derived) ;; mfannot: splice boundaries uncertain
;     G-cox1-E11 <== end
 16821  ACAAAAACATAGCCCCCATAGATAAATAATACTTCGAATGCTGAA
;     G-cox1-E11 <== start
;     G-cox1-I10 <== end
 16866  aagcaagctgtattccacacataacaagcgatttttcaacggcattatgcgttctgatga
 16926  aacaaagcaatatttttatcacaatagtataatatcatctaaacaaataat
;     G-cox1-I10-orf671 <== end
 16977  ttaacttttattaaaattaactttcaataatttttgtaatgaaaatccatcatatttacc
 17037  tgaacatattcatatataatgaattttacataaaaataattgtttaacaaaaaaaagtga
 17097  attctttcaaagtatctctgcagtcttatcaactttttcttcccgcgaagaaaaatatca
 17157  ttcagtagcttctaataaacaattcggaatacaacaacgaagtttctctactgaagtttc
 17217  taatgaaaaatcagacaaaattggaaaaaatactgaatctggagaaaaattagttaaaca
 17277  ccttttgtaaaaatttgttctctcagttggtatatataaaagaattactttacgggaatc
 17337  tttagaacatcgaactgttagatcaataccaaatttcttaaatgcccagtttgcagactg
 17397  ttttttataccgatgtgctaatgttaacgcagcacttcgttttaatgcatgtcaaaattt
 17457  gaaaaaaatctttcgagcaaaaataaaataataattttcaatattttgtataataagatt
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 17577  aacaaatttaatacgtttgcctaaacgattaatcctaaaaaatccgaattcaacatactg
 17637  tttaaataatttcattattggaatgttaaattgtaattgaaacttagaaaattcttgaaa
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 17757  aaaaatctttttttcagaatattttataaaaatattaaatttcaaatcaatacctaaaga
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 17877  aatacctaataaaatacaatttaaattccgcacataatataatttattatgataccataa
 17937  atattccttatttaataaatttaatgaatttttcattgttaaatatttgtgaattcgaaa
 17997  ttcgacaaacttatcaagctcccgaaaaaaaatatcataaaataacaagtttaacataaa
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 18177  atgactaataacgcttaaaaaaaaagtacaatttttaaaatcaaatatttgaataaattc
 18237  actcttgataaaccaagttacccccttccacttatctttaatatgttgcaaaaataaatg
 18297  attcttagtagtctcaaaaaacattttaaaagaaaatggcttaaacactacttctaaaag
 18357  tattttcaatgcctgctgaattaacttatctcgcataggtattaaactaaacaattttat
 18417  actaccataaacgttacttccaaaaaatcgcttaattggatgcggattataacattttga
 18477  ctctaattcttctgaaagctttacaatttgctctaaggtaagatttatcgaaaataactt
 18537  aactttcttgctattataataggatttcaaaaaataattacaataacaaattaacaaata
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 18657  aacgccagatccaatgtgaattaaaaaatgatctaaatctttaaaaaagattgtcaattc
 18717  tttaagagaaaaaatactttgaattttcttatcaataactacgcgcttaaacttattttt
 18777  gtaaaattttaacaaataccatgcttcactaatttgtttcatctgagatatttcacaaac
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;     G-cox1-I10-orf671 <== start
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 19173  aagaaaaatgttcatcttagattagcctttcaagcgttaatcgcccaacgtaatgaaaat
 19233  gtgctacaacataattgggatagtcaattttgctaagctatgtgtactcaactacattta
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 19353  tcctatttttcataaaaaaatgacttcataataaaacaaccaataatattaaaagcatag
 19413  tataatatttaaattaacaatgcacttagcctatttttatgaaaaatttaacttacataa
 19473  gatttactacgacagtaagtacttttataaaataaaataacgcattactaatttcaaaaa
 19533  ttcttaaaattaatctttaattcaattttctaaaaagaaattgtattaactaccctcaaa
 19593  ttactttgaactactaaatataaccagaaacgaaattacttcatataaaaatataacaat
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;     G-cox1-I10 <== start /group=II ;; mfannot: splice boundaries uncertain
;     G-cox1-E10 <== end
 19888  CGAAACCATAAGTATCATGAAGTGCAATATCAATTCCCGAATTTGCTAAAATAACCCCCG
 19948  TTAGTCCTCCAATAGTAAATAAAAATAAAAATCCAAAAGTAAATAAAACAGACGTATTAA
 20008  ATTGTATAACACCTCCTCACATAGTAACTAATCAACTAAA
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;     G-cox1-I9 <== end
 20048  ttagattggataaaaccataaattttcgccttttggttttaaactctattgaactttacg
 20108  caatacatcctatactataaagctcacatatataatttaaaacagcttactattaattta
 20168  ttaaaaaaacttttaataccctaagaacatatatgaatatttaagcattcaaaaatattt
 20228  agtaatttttttaaaatctaattaaataatatattgaacataaaaaaaatttagtaaaac
 20288  actaagataaattttttagtcatcttatatcataagatatgaattaaaaataataaaaag
 20348  cgaaatataaacaacgtactcaacatagccttagttatacatacttaaaatatttataaa
 20408  attaaatacttatattcaatattattcatttcccaaataaaagcccatcagtatatcaca
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 20648  ttttcaaaaatatcttaccctaaatttttttctaaaaatacaatccattaacaccacatt
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 20768  acgaaaataaatgatctaaattaaataaattattaataatgacatactgaacgtactact
 20828  ccca
;     G-cox1-I9 <== start ;; mfannot: no intron type identified
;     G-cox1-E9 <== end
 20832  AACTTTGATACCTGTAGGAACCGCAATAAT
;     G-cox1-E9 <== start
;     G-cox1-I8 <== end
 20862  aaggatgatcgatataaattttatctaccccttccgaaccttccaagctaattactcagc
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 20982  taatttctttactatatacaatatattgagaatataaaataaaattatccaaaataaata
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 21102  tcttaagcctataaggacattaaacatatttaatatattttaactaa
;     G-cox1-I8-orf385 <== end
 21149  ctaaactaaaataggtttatttaatgtaaaaaacaataacaatcccgtttggtaatatga
 21209  gatttctaaaaaaaatattggtacattactagtatgttgtatcgacgcaaaccgtcttaa
 21269  ttttaaaaacatattaagccaaatacaataacaatcagtagctattttagaatctgactt
 21329  aacacgtaaatgccaaggtaatccataaggagaacagtttgcttgatttttcaaaaaatt
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 21569  agctaaaaccaaaagacttttaatagtttgaatcaaacactgttttaataaactaaaaac
 21629  ttgtcaagtagggtatatagacactattctcgaagaataaaaacaatctgaaattaaaaa
 21689  attcttacttaccgctccaaatttaataaaaaatataaagcctaaatagaaacaataaat
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;     G-cox1-I8-orf385 <== start
 22307  attccgtgtaaactttgcttcataatagggttcaattaaataacaaaaaataacctgtac
 22367  tacattatctggaaagtttctttctacataacctattcatttttttttatttcaattaat
 22427  tcaaaatcattttcgaaataaacgaaatgtgcttaataaaatacaataatttgattcttt
 22487  aataccattaatttttccagtaaattttctaattctagaaaaaatatttcctatgtctgt
 22547  taccgccaaataataaatacaaatattaataataaatttatttattaatacaaacgaact
 22607  agcatcttggttattagatgaaagacgacaaatttctcgttgtaatttatacaatatccc
 22667  caaaataaatttatgaaattttatacccaattgccaaaccccgcactcaaggcacttaac
 22727  taattgatttgtatagaatttaaactgtgataaaaaaaaccgttctattttttggcctaa
 22787  atgcacctccctaaaaatcaaattttcataaaaaatctacaattatttctcttaacccta
 22847  catttataaatacccttaaatctagttaaaagcattcaatctgaataagtatataaacct
 22907  acttataaaatttacctaaaatctaaaaatcaaatactcatagtatacatatttaattta
 22967  agatatttttgctgttttacttaatttgaatttactgtttaatcaacacattgaatcctt
 23027  aataaactatattaatttttagacaaaaattatataatattttatcacacaaaaagcaat
 23087  attctaacagtacaccaatatcacaaaatattttaagtgcatcaaatcaatcaaaaattt
 23147  gaaatttatataatttaatccaaaattaaaacaatttttccaagaattataaatagaaaa
 23207  attatgtatttaatttatttctaataattaacttagaaataaccaccaacatcgcaaaaa
 23267  aagtatctttaataatctatcat
;     G-cox1-I8 <== start /group=II ;; mfannot: splice boundaries uncertain
;     G-cox1-E8 <== end
 23290  CATAGTTGCTGCTGTAAAATAAGCACGAGTATCTACATCTAAACCTACTGTATACATATG
;     G-cox1-E8 <== start
;     G-cox1-I7 <== end
 23350  gttaagatcgaggtacataacctctccctcttgaactgtgcatgccagttagccagcaca
 23410  cagctcacaataaaaaaaaatctttttaaacgattactaattaaacaaggtttaattacc
 23470  tttaattattttgtaattttttcactaaaataatacataatatagcacaaatattaatta
 23530  gttaagttataaagtaaatctaataatatttttaaaatcttccaattacaaaaattttct
 23590  cttaacgctctgatattatttttcctaaaaaaaaaataaattcaaaatcctaaattccat
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 23710  tagaatcgctatatgtaatttgtactatataaaaagcaaaatccaacggatcctcttaca
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 23950  attttttttacaaaactatcttcataaattaacaaaaattttaataaaaaatttaattaa
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;     G-cox1-I7 <== start /group=II
;     G-cox1-E7 <== end
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;     G-cox1-E7 <== start
;     G-cox1-I6 <== end
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 24316  caactgacactttaaaaattctcttatataagatatcaaaagcacattaaaaataaaaaa
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;     G-cox1-I6-orf676 <== end
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 24868  aagcctattcccatactgtatatgaaaaattttcttaaaataatcctggcacaaacagta
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 24988  attacatatatatataaaatgaaaattcaataaagaataatatcaaccaacctccctaat
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;     G-cox1-I6-orf676 <== start
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 26659  tttatattcaaataaaattaaattgaactgctactatttttagagttgtataaacaccac
 26719  ac
;     G-cox1-I6 <== start /group=II
;     G-cox1-E6 <== end
 26721  GCATAAACCATACCTAAAAAACCAAAAATACGTTTTTTTGAAAATAATTCTATAGTTTGA
 26781  CTTATTGTACCAAATGCTGGTAAAATTAAAATATATACTTCTGG
;     G-cox1-E6 <== start
;     G-cox1-I5 <== end
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;     G-cox1-I5-orf550 <== end
 26923  ttataaaaaaaatcttttattcaaactataaataataaaatgccaagcaaatcaaataga
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 27943  aatccgattataatttaactgcttagagtagaaagcaactaaatttttctttgtaatttt
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;     G-cox1-I5-orf550 <== start
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;     G-cox1-I5 <== start /group=II
;     G-cox1-E5 <== end
 28807  ATGACCAAAAAACCAAAAAAGATGCTGAAATAATACAGGATCACCACCACC
;     G-cox1-E5 <== start
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 29098  aaatttttaaacacactctcagatactactacaagaaaatctaaattaaattaattaata
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;     G-cox1-I4 <== start /group=II(derived)
;     G-cox1-E4 <== end
 29420  TGCCGGATCA
;     G-cox1-E4 <== start
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;     G-cox1-I3 <== start ;; mfannot: no intron type identified
;     G-cox1-E3 <== end
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;     G-cox1-E3 <== start
;     G-cox1-I2 <== end
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;     G-cox1-I2-orf580 <== start
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;     G-cox1-I2 <== start ;; mfannot: no intron type identified
;     G-cox1-E2 <== end
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 32464  ACTGATCAAACAAATAAAGGAAGGCGTTGTCAATTCATACCTAACAACCTCATATTAACT
 32524  ATCGTAGTTATAAAATTAATTGCACCTAAAATTGATGAAATTCCTGATAAATGTAAACTA
 32584  AAAATAGCCATATCTACAGACGGTCCTGAGTGCGATTGTTCTGCAGATAATGGAGGATAA
 32644  ACCGTTCACCCGGTACCAGCACCTACTTCCACTAAAGATGAACCCAATAATAACAAAAGA
 32704  GACGGAGGTAGTAATCAAAAGCTTACGTTAT
;     G-cox1-E2 <== start
;     G-cox1-I1 <== end
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;     G-cox1-I1 <== start ;; mfannot: no intron type identified
;     G-cox1-E1 <== end
 33328  TTAATCGAGGAAATGCCAT
;     G-cox1-E1 <== start
;     G-cox1 <== start
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;; mfannot: G-cox1 <== start Def by similarity
 33404  TTAACCAGTTAAAAC
;; mfannot:
 33419  cccctcaaagaaccatatttgcaaagcaatccacacatggctc
;; mfannot:     /group=II
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 34182  TCTACAACAATCATGTATAAATTATGAATGCGCGATAAATCAATCCATTTTTACCCTATT
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 34782  ACAATAAATATAAAGGTCAGGTAGGTACATATATTTTTT
;; mfannot:
 34821  ccctcctattaatctgtacatgcgttacaacgcatacagctt
;; mfannot:     /group=II
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 35283  GGATAGAATTGGCAACTAAGCAA
;; mfannot:
 35306  atcccccaagtaaactgtacatatgaattaacttcacatacagctt
;; mfannot:     /group=II(derived)
 35352  AATTCAGGTTAAAAAAAATTATTATTACCACTGTCCATTTAAAAAAATGCTATATAATAA
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;     G-orf526 <== end
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;     G-orf526 <== start
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;     G-orf504 <== start
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;;     G-rps11 ==> end
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 74978  AAAAAATACAACAGGAAATTTTAGCTGTTCTTCAAAAGAAAAGTTTACTTTTTAAGCAAA
 75038  ATAGAAATCTGTATCAAGTTGCGTCAACAACAGATCGTTTGCACATTACCGGTGGGATTA
 75098  GTTTTTACGAAATAGCGTGTCATATATGTGTAGTACAAT
;     G-trnP(ugg)_1 ==> start
 75137  CGGAATATAGGCATAATGTAATGTATCTGATT!TGG!GATCAGATGAGTATAGGTTCGAG
 75195  TCCTATTATTCCGA
;     G-trnP(ugg)_1 ==> end
 75209  AGTAAGGTATTTATTATAATTAGAAGTGTATATGAAGCGAATTAAATATTTTAAATTTAA
 75269  GTTTAGGGATATTTCAAAGGAAATTATTTAAGAAAGTCATATTTTAGATTGTTAAAAACA
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 75509  AAGCATGTTATTGTGAATGGACAGCGGACTCAATTTTGCAATTTGCATATAAAAACATTT
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 75869  AAATTTTTATTATAATTATTTTTAGGTTTATAATGAGTTTAATTTTAGGTGATGTGTGTT
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 75989  ATTGTTTTTGTTGGATTGGAGCTAAAGGTGTTGCTTTTATAACTTTTTTATCTCTACTAG
 76049  GGTCATTAATTTTAACTTGTAATTATTTAAGTTTTATAAGTTTTTATTTGGTTTCAAATT
 76109  ATGTATCCGTATTATCTTGGATGAAATTAGGTTCATTTTATGTGACATGGTCATTTTGTT
 76169  TTGATAGTTTATCTCGTTAATGCGGTTTTTTAGTTACTGTGTTAGTTAGTTTAGTTTATC
 76229  TATATGTGCGTCCTAGGTTATTTTTATTTTATAAATTTATTAAAGTAAAGTTGGAAATTT
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 76409  TCAATATACAATAACGCGTAAATAAAAACTTCAAAAAAGAAAAAATATATTTAGTTTTAT
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 76529  TCAATTTTCTTGATTCAAATTGAAGTTTTCGTTTCTTAATTTTCTTATGCCCTCCAAATC
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;;     G-rpl16 <== end
 76605  TTATTTACA
;;     G-rpl16 <== end
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;;     G-rpl16 <== end
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;;     G-rpl16 <== start ;; 86,134
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 76998  AT
;;     G-rpl16 <== start ;; 4,91
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;;     G-rpl16 <== start
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;     G-orf424 <== end
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 87001  AAAATGGGCACGTCTGAAAGATCTGTAGCACTTGTCACATTTTTGATTTGCATAACTTTT
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;     G-orf1225 ==> end
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 96713  AT
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;; mfannot:     /group=II
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;; mfannot:
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;     G-nad5-I2 ==> start ;; mfannot: no intron type identified
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;     G-nad5-E3 ==> end
;     G-nad5 ==> end
100741  ATTTAGTAGTGAATG
;;     G-nad6 ==> start
100756  ATGTTAGTTTTTTTT
;;     G-nad6 ==> start ;; 4,70
100771  CAATTTTTCTTTTATTTGTTTTCGAGCGTTGCTAGTATTTCAGCGGTGATGGTAATCCTA
100831  AGTACTAACGCAATCTATTCAGGTTTATTTTTGATTTGAGTTTTTTTTAACTCAGCTTTG
100891  TTGTTATTACTTTTAGATTTGGAGTATTTAGCTATAATTTTTATTATAGTTTATGTTGGT
100951  GCAGTTATGGTTCTTTTTTTA
;;     G-nad6 ==> end
100972  TTGTGCGGATACGAGACATTATGGAAAAATTGTTATAAAGTGTATTATGAAAAATTGACT
101032  AAAATTTAATATTTTAAGGAAAAGCGTTAGATGTCAAATATTCTAATTAAAATCAAGATC
101092  TAAATTTATATGCAATGTACTTTTAAATTTGAATTGTAAAAGTTTTTATATTTTGTTTTG
101152  TTTGATATGTTTTAATGTTTGACTAAAGTAATGTTGGGTAAGCATGAAAAGTTTTGTGTT
101212  ATGTTAAAATTATAGGTTTAGTCTTGCATTTAATATGAAAAAATGTAGTATAGCTAAGAA
101272  CTACTTATATTGAACAGATTAGAAAAATTTAAAAGGGATTTTATTTAGGAATAAGTTTTT
101332  ATAAATGTTTAATGTTATCGTGTTGATTTGGGAAAAATTTTTTTCAAAGAAGAAGGTAAA
101392  ATCATAATTTTTGTAAAAAAGAAT
;     G-orf688 ==> start
101416  ATGTTAGTTAATTACAGATACTTTAAAAAGTGAATTAAGATTTTTAGAAATGAAATTTCT
101476  TTAAATTTTTTATGAAAATTTTTAGGGTTTGTACCTCTGAATATATTAAAAACTCAGATA
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101596  TTGAGTTGTCTTAAGAAAATTAATGGGAAGTTTAGAAAATTATTTATTCGTTTTATTATT
101656  GACCCTGAGCTACTGTGGTTAGCCTATATTAATTTAGTGATAGTTGGAGTGAAATGAATT
101716  TTTAGAAAAACGCGCAAGTTTTTACTATATAGTTTAAGTTGTAAATTTTATTATTTTGAT
101776  AACTTAAGATTTCTTTTAAGAAAATTAAATATTTATAATGAGAAATTATATTCTGATGAT
101836  AGGCTTCAAATTACATTGATACAAGAAAGCATTCGGCTATTATTTACAGTTATAATTGGA
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101956  GGATTTGTATTTGAATATATTCGACGAAATTGTGGTTCTATGCGTTGATTTATTGAGTTT
102016  GTTTTAAAGAAAAAAAAAATTACCCTGGATATTTTAGTTTTTTTGCAACGTTTACTTAGT
102076  CTCTATGTAGATGATAGTCAATTTGTAGGTTTTTTATTTAAATTGCTTAAAAACAATATA
102136  CAAACTGTTAAACTAATTGATAGCTATCAAGTGTTAAAGATCGATTTGTTAGATTGGTTA
102196  TTATCGAAATTTTATTTTTTAACTTTAGATAATTTTGTTGAGAAATTATTTGTAAAATGC
102256  ACTAATACTAATTTTTGTATTTTGAATAGTGCACCGCAATACAATTTAATATTTAAATTT
102316  CCTTTTTTGAATGTAAAAGTTTTTCCAAAATGTAGTAATGGTTGTGTATTATCTTTAAAA
102376  TATATTCGGTATGGATCTAATTTTTTAATAGGTGTTAGTGATACTTCTAAAAATATTGTG
102436  GATTGAATTAGTAATATAATACTTAATTATATAAATTCTTTTTTGTATCTTGACCAAATT
102496  TTAGTTGTAAAAAAAGTTATAATCAATAATTCTCTAATGATTAGACTTTTTGGGATGCGT
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102616  AAAATGAATTTAATTTTTTCTAAAATACATTATTTGCGTTATAATCTTGATATAGGGGAT
102676  AATAAATTTAGATGTGAGCAACATAATATATTTTGTTGAGAGTATAAACAAATAGCATCA
102736  TATATGTTTCCTGTAAGCATAAGAAAAAAGATTTCTTTTTTTTGTATATATGTGTATTTA
102796  CGTGATAAAATAAATGATTTTAGTGTAATATTTTGAAATATTAGTGCGTTAAATTACTTT
102856  GTAATTAATTATGTACCAAGGAAATTGCAAATTCCGTATCGTGTTTTGCTTAGACTGATT
102916  AAAAATATAACCTGCTCTAGGTATACTGGATTAATAATTAATTACTGTGTTATGTTAAGT
102976  TATTTATTATGGTTGCAAGAATATAGTAGCGGCGTCTTATCAAGAAATTTAATGCTATAT
103036  TATTATCCTAATTTTGAAAATCAGTTTATTGTATCTAAAAAGTTTACTGTTCGGTTACTT
103096  GTAGATACTGCTTTAGTATCGCGTTGGTTATATAGTGTTGGTATTATTAATAAATTTGGT
103156  TGCCCGCTAGTTAAACGTAAATTGATTTTGTTAGAAGATTTTATCATTGTATTGTATTAT
103216  CGGAAGTTAGCTTTTAAACTAATAAGATATTATTTATATGCTAATGATTGAGTTAAATTA
103276  TATAGTATTTTATTTAAGTTAAAAATTTCGTTGATGAAGACTTTAGGGGTTAAATATAAA
103336  TTGAATATGAATGTAATTAAGCAAATTTATGGAGATTCGATCTATTGTTCATCTTTAGAT
103396  GGGAAGTTTATATCTTATTTTTTTAAAACAGATTTATATTTATATAAGCGCAAATTTTTG
103456  ATAAATTTTTTCAGATGAAAACAGTAG
;     G-orf688 ==> end
103483  AATATAATGTATAAAATGGTAGTTTAAGAGAGTTAGAGAGAGAGTTAAATTTTTTGTTAG
103543  TAATTTTCTGAGGAAGTAATATATTG
;; mfannot:     /group=II
103569  gagctgt
;     G-orf132 ==> start
103576  atgataaaaaattatcatgtacagttttggatgggag
;; mfannot:
103613  TTAATTGCTTACCTAAAATC
;;     G-nad6 ==> start ;; 72,199
103633  ATTGTAATGATGTTAGACGTTAAATATCAATCTATTAATCTTGAAATGGGTTATTATCAT
103693  ATTATTGGAGGAATTGTGTTATTATGTTTAATGGTAAAATTTGTAAATATTTTAGTAAAT
103753  GAATTAATTTTCGAACATGGTTATTTGATGGGGATAAGTGTAGATTATCTAAATTGGTTT
103813  GATTTAATTGTAGAAGTTGTAAATATTCGTAATATTGGGTTGCATTTGTATAATTATTTT
103873  TTTATTCCTTTTATAAGTGCTGGGTTAATTCTTTTAGTAGCTATGATTGGGGCTATAAGT
103933  TTAGTTTTGCCTTCTGAGACCTCGAAC
;;     G-nad6 ==> end
103960  TTGAAAAGTTATTAG
;;     G-nad6 ==> end
;     G-orf132 ==> end
103975  TTTTAATTATTAAATAACATAGAAATTGGGAGATTATTATCTTTATTTGTAGAGAGTACT
104035  GGTACTTATAGTATTTTAAAC
;     G-trnR(ucu) ==> start
104056  GCATCTTTAGCTTAATTGGAAAAGCATTGATTT!TCT!AAATCAATAAATATAGGTTCGA
104114  GTCCTATAAGATGTA
;     G-trnR(ucu) ==> end
104129  GTGCAATTTAATTTCAGAATGTAT
;     G-nad3 <== end
104153  TTATCATTCTAATGCACCGCGCCCTCATTCGTAGTAAAAACCAATAGTTAATAAGAATAA
104213  AAATAAGATCAT
;     G-nad3 <== start
104225  ATGATAGAATACAGAATAAGAGTTTAAAGTAAGTGCCCATGGAAATAGAAATATGATTTC
104285  TAGATCAAATATTATGAATAAGATAGCTATGAGATAAAATTGTACAGAAAATGTATGCCT
104345  TGCATCTCCAAAAGAGTG
;; mfannot: G-nad3 <== start Def by similarity
104363  GATAGGTTTTATAAATTTATAATTCTATTT
;; mfannot:
104393  accttcctagaaacttaacaagttatttttaaacattaagctt
;; mfannot:     /group=II(derived)
104436  TGCATAGAGAAATTTCAAATTGAGGTGTAGAGATTTTAAAATATTAAGGTAGATTTTAAT
104496  TTTTAGTAAATTTTTGAAATTTAGTATGTTTTTATTTATTTTAATATAAACAATATTTTG
104556  TGTACGTTAAAAGTATAAAAAATCCATGAATTCATATAACCACTCATATGAATTTGCGAT
104616  TCTATCTTCTTAGAAAAAGATGATTTAAATTTTTATTTTTACTTTTAAAAAAATTAATTT
104676  ATAGTTTTGTTAATTATTGGTGTTATTTATTTGACTAAAATAAATAAATAAAAATATTGT
104736  TTTATTACATATTATATTTTGGTGTATTAGATACATGTTGTATATTTTAGAGGTTATTGT
104796  AGAAATTGATGATTAGTTTTTTTTAAATTATGCTATAAAAAGATAGAAAACTGCGACACG
104856  GTCAAAACCACATTCGTATGCTGAGTATTTGTCGAAATTACTTTTACGTTCACCAGCTTG
104916  AATAGTTAAAAATATAAGAAGTATAGTTATTAATGAATTTATAATTATAAATAATAAAAG
104976  TGAGTAATATTCAATAAAATTTGTAGGAATTAAAAAATAAGACATGATTTTAAC
;     G-atp6 <== end
;     G-atp6-E2 <== end
105030  TTAATGCGATAAATTGATTGCGTCGTTTAAATATAAGCATATTAGTATTGTAAACACGTA
105090  AGCTTGTAAAAGTGCTATTCCTAATTCTAGGACAGTTACAGCAATTATTATTAATAGTGG
105150  GAACATAGCTAAAATATATCATAATCCTCCAAAATTTATCATAGATCATGTAAAGCCAGC
105210  TATAATTTTTAACAAGGTATGGCCTGACATTATATTGGCAAAAAGTCGAATTGAAAGACT
105270  AAATACTCTGGTGATGTAGGATATTAATTCAATTGGAACAAGAAGGGGTATAAGTAATGC
105330  ACTGATACCATTTGGTAGAAAGAATCCAAAAAACTGGAATTTATGTCGTGAAAAAGCTAT
105390  TAAATTTATTCCAATAAAAAATGTAAGTGCTAAACTAAACGTTACAGAGATGTGGCTTGT
105450  AATAGTGAAAG
;     G-atp6-E2 <== start
;     G-atp6-I1 <== end
105461  agtaagaatttttttatcttctcgcagaactgtacgtgagtattattactcatacagctc
105521  tttttagattttatataattatcttataacagtaacgtgagaatactaagttcaatgttt
105581  ttgaaaaattaactttttaatttttgttaagcttttgcttaatagagagtacttctttat
105641  tattatttgtgtttatttttatcttgaaatatttga
;     G-atp6-I1-orf499 <== end
105677  ttatcttttgcatttaaaagctaatgtacaatataatgatttttttagatgataatcaat
105737  aagtttttgaatttcttgtatgttatctgtatatttatagtaaaccgataagtttgatgc
105797  ttgtaacgcatatcatcatattattttactaattggtccatatgatatgactatacaatt
105857  ttgtggttgtccatttgttgaaagtatacctttatttttccaattttgttttattttttt
105917  aataggcgcatataattttaaatagctttgttgtttttgtatggctttggttattgaatt
105977  ttcatagatttttgatagtcaatttttttttattaaaatgcttttatatgttttaatttg
106037  ttcttctaaaatatgtgttgtagctaagatttttttgggaagtattttgttgatcgctat
106097  tagcgagtttaatattgttttggagaaaattggttttaatgaattgagattaagggtttt
106157  aattagtgcagttaggtactcttgtgtatgcagaaaattgagattttttgaatttttaga
106217  tatagatttatataaactaaatttcaaatttttcttggttttttttaaattttgatgctc
106277  cgtattattttttattcactttcaatattttgttaatcttgctatatattctgttggatt
106337  attgtttatatgatttttttttttatgtatgttaactccaagaaaattgacataatgttt
106397  gtttgcttgggagcatattgggttgattatcgaaattaagggtaatttattttttgaaaa
106457  tatttttattttattatatataaattttactaagtttaatgatccataaaatccgagtag
106517  taattcgttgttatatctatgaaattgtattttaaaagcgctatgtatattatagcgatt
106577  tatatttgataaaaattggtctaaagtaagtaagtatgtattactaagaattgaaaaaag
106637  attgcttactttgaaaactgaattgctgattgtatctgcgtattctttgattaagatatt
106697  tataaattgtttatccatgattattttttttagcggtttaaaaagttttataaaatttat
106757  gctagtaatatttactgttatatttaactttaaaaatcattttatattgtttcatgagtt
106817  ttttatattgaaaagtatatcatgtggtccaaaatttgtttgtattccaaatgagttttt
106877  gtggaattttggttctaaaatagctaataaaattatttgtaaagctttatgtttcttaaa
106937  aagaaatggtggagtatttttttgtcacatttctatgaggattatcaatctaatgaaaat
106997  tttatttaattttttgtattttccttttttatagagcttagttattcatttatttacaat
107057  tatgttaatagtttttgttttagtattgaaattgtaatgaattattttttttggacaaaa
107117  tttaattaattttattatctggttcaaattggggtatatatattttataagatgtttcat
;     G-atp6-I1-orf499 <== start
107177  ttttgtttctaaagttttctacttatatattttataattgtgtagaatctcaatgcaacc
107237  tttcgatttttttgaaaaatctatagaaaggcgctatagtagtttctcatagtttatcat
107297  aaaatagtttgtattttttaaaaaaggttatgattttatcataaaataaattagaatttt
107357  atagtattattagatttttttaaaaaaattgctgtgtcaaaaatgcttctgtttttctag
107417  caattgtaattatcgatttatagttgtgttagaattaactttgtaaggtgaataaaatgt
107477  tatttaattatgcagagtttatggtaggtttgtttaatcaaccttttagatattctaaac
107537  ctgtttctttaatatctcttgtatttaagatagtttggttagtaataacgttaacatgtt
107597  aacaggcagtagccattataatttgtgagaatcatactccgaataagc
;     G-atp6-I1 <== start /group=II ;; mfannot: splice boundaries uncertain
;     G-atp6-E1 <== end
107645  TATAGGGTATCATCCCTAATAGGTTAGTTAATGCTATAGAAGAGAATAGAGAAAAGATTA
107705  AAGGAAAATATTGTAGGCCTGCTTGTCCTATGTTTTTTTCAATAAGATTTCGGTTAAAAA
107765  TTAATAATTCTTCGAGAATGGATTGTCAATAAGATGGAATAATTTTATTATTGTAGGTAA
107825  TAATGTGAAAGGTTAGGAGTATACTTGCAAAAGTGATTATTGCAAATATAGTAGAATTTG
107885  TAATAGTTAATTGTTGGTTAAAAATCTTAAGATTTGGAAGTAATGCAGTTATTTCGAATT
107945  GTTCTAAGGGTGAATGGTGTAGCAT
;     G-atp6-E1 <== start
;     G-atp6 <== start
107970  AATATTTATATTTTTTAAGAGGTTGTTGGTGATACTTAAAGTAATTTTATGATGTATACG
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;     G-rps10 <== end
108059  CTAAATTTTTGTTAAGATTTTTTGTTTAAATTGTATAGTAAGTGAATGCGGTAGATTTTT
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108179  GTATAGTGTGTATTTATAGGTTCGTATTTCTAATTGGGTACGTGCTGTTTTATGGACATG
108239  TGGTGATTTAAGTATAGTAAATTTTTTGATATATAAAGGTAAATAGGTTTTTGTTATTTG
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;     G-rps10 <== start
108413  TAGTATTA
;     G-nad2 <== end
108421  TTACAGTAAAATACTTAATTCGTGAGTTGGAAGTAATAAAATGTTTGTTGTTGTCAGAAA
108481  TAAACTGATTAATAGTGATCCAGAAAATATTATTAATATTGCAATAGTACTATCTAAAGT
108541  ATATTTTTTATAATTTAAATTTATAAATTTTTCGAAATTAATTATTTTGATTAATCGTAT
108601  ATAATAATAAGTACTAGTTGTACTTGTTAATATACCTAATGCAACTAGAATATAAGAATG
108661  TAAATCAATTAAGGAAAGAAAAATTTGAAACTTGATAAAGAATCCTCAAAGGGGTGGGAT
108721  TCCAGCAATTGAAAATAGTAGTAGAATAAATGTGAATTTATACAATGGATGAATTGTGTT
108781  TGGATTCAATAAGTCTGTTAAGTAGATTAAATTTTTATTTGTGTTTTTTTTAATAAGTAT
108841  AAGAAGCCCAAAAAAACAGAATATTGTAGTTACATAGATTAAAAGATAAAGAAAAAAAGA
108901  ATGCAAACCGAGCATAGTTCCAGTTGAAAGTCCCATTAACATATAACCTATATGGCTTAT
108961  AGAACTATAGGCTAAGAAGCGTTTTAATTTTTTTTGATATAATGTTGCGAAACTTGCAAA
109021  AATTATGGTTAAAATGGAAGATAATACAAATATTGGGTGTCATAGATTATGGAATTGTAA
109081  AAATACTGAGAATATGAGTCTGATAAAAATGCTAAAGATAGCTATTTTTGGAATTGTCGA
109141  GAAAAAAATTGTTATAGATAATGGTGCGCCTTCGTAAACGTCTGGACTTCAAATATGGAA
109201  AGGTACCGCAGTTAATTTAAGCAAAAAACTACAAAGCAGAAGAATGAATCCTAATTTTAA
109261  AAGAATTGGGGTGTTTTGAATAATAATTGTTAACTGATATAAATTGCTAAAATTAGTTGA
109321  ACCTGTAAGACCATATATTAAAGAAATCCCAAAAAGCAGAAAACTAGATGAAAGGGCGCC
109381  TACTATAAAATATTTTAGACCTCCTTCTAAGGAAAATCTAGAAGTTTTTTTAGAAGCTGT
109441  TAATATATAAAAACAGAGGCTTTGTAATTCTAAACTTAGGTAAAGAATCACGAAATCATT
109501  AGCAGAAGTTAATATAAGCATTGCGCTAAGGGAAAGCATCTTTAAGATGATTGATTCAAA
109561  GTCAGTTGGGAAATTTTGTTTTTCGGAATATTTGATTAAGCTTAAGAAAAAAATTGTGAA
109621  TAAAATTATTAACAATTTTATGTTAGTTGTATAATTATTTATAACTAAATTTTCATAACA
109681  AATTGTTTTTGTTATATTTAGGTTATTAAGCATTAGAATAAATCCTAGTATTGTTGTAGT
109741  TATTACTAAAGTAATAAGATTTTTTAGTATAGATTCAGCATTTATTTTATGCATAGTAAT
109801  TTGAAATGTGCTTCAGATTAGAAGAAAAATAGTTATGCTTCCGATAAAAATTTCTGGTAA
109861  AAGAAAATATAGATCTGTATTGAGTTGAGTCAT
;     G-nad2 <== start
109894  ATAAGAAAGTTTAATTTATTTAGATTTTGGGTAGATAGTTATTTAATGGGGTATTTATAA
109954  TAAATGGAGGTGGTAAAGTATTGTAATGGTAAATACATATAAATTTA
;     G-nad7 ==> start
;     G-nad7-E1 ==> start
110001  ATGGAAAAACGATTAATTAAAAGTTTTACAATGAACTTTGGGCCACAGCATCCAGCTGCG
110061  CAT
;     G-nad7-E1 ==> end
;     G-nad7-I1 ==> start /group=II(derived) ;; mfannot: splice boundaries uncertain
110064  ttacggtagtaaggttggttaattttattgtttatttttgttagcattgtgtaatgaatt
110124  tttttaagataatgttttttaaaaaattttatatgagaatcaatttataatatatataca
110184  tgcattctataactttaatttttgattaatttttaatctgatgggtatgtttaagaaaaa
110244  ttttatatgtttttagaaattagagattaatgcgtgttttaattattattagtaaatata
110304  atacctagggaaatctgtgatattttattcgataaagaagaaattttaagtaatctatac
110364  ggaaatttttcagtttttaatattgttgaagaaaattatttagatattaagtttttacga
110424  cgtagttagcttgttattatataaattttttgatctcttgcagaaaatttgaaaaagtag
110484  atgattgaaaatgttttaattttttgaagtaaaatttagattaacaagataattcaattt
110544  agcttagagaatggcaattattaaatcggtattaatttaaagatatttttttattttttc
110604  gattttaaaatttttctctttaggttgagccgtatattcatggaaattatatttacggtt
110664  ctttgaaaagggatttctctctatttcagt
;     G-nad7-I1 ==> end
;     G-nad7-E2 ==> start
110694  GGAGTGTTGCGATTAGTTTTAGAATTAGATGGTGAGATTGTAAAGCGAGCTGACCCGCAT
110754  ATTGGATTATTACACCGGGGTACTGAAAAATTAATAGAGCATAAGCTGTATATACAAGCA
110814  TTGCCATACTTTGATAGATTGGAT
;     G-nad7-E2 ==> end
;     G-nad7-I2 ==> start /group=II(derived)
110838  gtataagggctttaactaaataatataattgtattgagtcaggatttatagttaaattta
110898  ttttcgttttttttatatagtataaaaattttatcttaaatgcaacgcactaaatattta
110958  atttttgcttgtataaagaaccttggtatgattaaataattttataaacaattaagttgg
111018  ctaatatgttatattttttacattgcagattaaattagtataataatttttatgtaataa
111078  gtattttataggatctatatgcattaatcaagttaacttactaataatttttgaaaatga
111138  tatgagtccagtattaaatgaaattatggttaaattataaaataggtatagtattcttgt
111198  ttataagtggaaagttaatatattaacaagttaaagtttatttataaccttaattggttt
111258  tatgtaaaggatttttgcagtttatagtgtggtatgtaaaaagatgtgatttactttatt
111318  aagtaaataagtttacttgttgtaatataaataatatatggtgaaaactagtaaatttaa
111378  taattatcaaagagccaagtattttgtaaaaaatttgtttggttcggaatgggctaaaaa
111438  attatgctatacatctaattttgatatataggaaattcaaacagctaccattac
;     G-nad7-I2 ==> end
;     G-nad7-E3 ==> start
111492  TATGTTTCTATGATGGCACAAGAACATGCATTTTCATTAGCTATTGAAAAATTGTTAGGT
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111612  TTAAAT
;     G-nad7-E3 ==> end
;     G-nad7-I3 ==> start /group=II
111618  gagtaggaagctgttagattagtattttattggctagttattgtttaagtaattaggctt
111678  tttaatgtatttaaacttaagcctaaactatcgtaactttgtatttcttttgaaagagaa
111738  atttaagtatagtactcctaattagatagtattttgttccaaaacaaataaaaggaaaga
111798  ataacttttaagttaatatgtttttattttttgacatattttttattgtgggttgggcgg
111858  acagtaaaatttaattaattcatgttatatttgtaagtaaacttaaaataggtataggtt
111918  taatattgaaaagaaaagtttaagttttgattttattataaatgaaagaggtatttggta
111978  caatttaataaaatacagtaaatatacaatagtgtttttattaccatttttgttagaatt
112038  tagattaaaaatatataaaatcgttttacttaatagtggtataaattcagaaattttcac
112098  aaatctttattatatggggatagcgaaattagtgaacaattttttct
;     G-nad7-I3-orf505 ==> start
112145  atgtccaaaaatagtttcttgagattgcgtttaaggcatagagagttagttactgattgt
112205  aattttttttgtcaattatttttggaagcacggcaattgcttagtagtgatttttttcct
112265  acagaaaagtatagttttagattaaaattaattagagaagtttttaagttgcaaaaaaga
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112385  gtatctcatttatgtgtacgacttttcgtcataggcgcgctaaaaggtagcataagtgtt
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112505  ggttggtttttaattggacttaaatcattatataatgtgaaaaaaatttattttaaaaaa
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113045  cgtgtgtttattataggaagtattattggggttattactgtttctaattcagttttgagc
113105  cgtttttattcaaatattattaattatttaaattttagaaaaattgtaaattatgatttt
113165  ttgaagatgtgttatgttgatttttttcatgtaagaaaatttaattttttaggttgacag
113225  gcgttttttactcgtagagtttgaataagcgtagcattgagcaaaaattatttgggtttt
113285  agatatcctttgaagagaagtgttactggtttacttgaatggcgaccttgtttttatcat
113345  cgtttgggatttaagaaggcaattaagtgggaaatttttaaatctccttataatatacga
113405  attattatatttgttaaagtatatttaattatgcggaattttgtttggtattatttatat
113465  atagataattttattatatactttatattgttgtgttgttttgtatctaggtgcttgagg
113525  agaaatttaaaatataagatgtattgtggtaagagacgattattttctaatttgatttga
113585  aaagtgtttttcggattagatatggtctttttttataaaatttgaggatactgggtgaga
113645  atatttttaaaatattaa
;     G-nad7-I3-orf505 ==> end
113663  tttggttaataaataagatttttagttaagattagtattagaattttaacatttagtttt
113723  tgatttttattttaaattgtatgtattttaaaaaatttaaaaatacaaattaaaagaaga
113783  tattaataaaattaaggggaaataatatatttaagctttagttattaagttaactttggt
113843  ttagatttaaggcgctatataaaggttttattgtttaaaattgttatatttatatatttt
113903  tagagatacatattttgaaaaattcggttcatgatgagcctaatacggggcaactcgttt
113963  gtttggttctgagaagaggaaatttagtacttacttctat
;     G-nad7-I3 ==> end
;     G-nad7-E4 ==> start
114003  CATTTAATGGCATTAACTACTCACGCAATGGATGTGGGGGCGGTAACTCCTTTTTTATGA
114063  GGATTTG
;     G-nad7-E4 ==> end
;     G-nad7-I4 ==> start /group=II(derived)
114070  gtgtaatttgttttttctatttatataatagttttaatttagcaaaaaatatttaaaaaa
114130  ttgattttaggattttgtgaatgcagagattagtacgaattttctaatatttatggctta
114190  tgatacaaatatgtatcgaaattcaaattatttttttgtggttgttatactataaaatat
114250  agtatttaattttacacaggctgttaaaattaataatgaatgtgttcacttagattaaat
114310  tagtttatgattagggcataaaaaattacttaaaaattttaaattagcggtctaagctaa
114370  cgtgattaagtatagaaatttgtgaattaaaaattactattaataaggtatttaggtacg
114430  aatagcgtgtttttttaattagattaggtattataatgtaatattga
;     G-nad7-I4-orf511 ==> start
114477  atggagttaatatttcaattatatgaagtaaaatttgaaattaataaaattaataaaata
114537  ataggtaattattttagatatttacgatgacctattggattaggtgtaggttgtttgatt
114597  agaaagatagccatttttattcaatatttgattcgtgtgggttttattgtaaatgatgta
114657  ttttgtgttaaattgcagagagaatttttttgctcgataatcaatcgacttcttgttgta
114717  gattacatatcgcattttgtttacagagcattgaagaaaatttttcaatttttaatttga
114777  gagtgaagatttgaaataattaataaatttaagcaaaataatttatataactatttaaat
114837  aggaacatttcttcaattttgttttatgaagaggcagcacaagttcttattttaaatact
114897  acagtatcttgcctagaggtatttactgtatttggattattcattttccaacatattcga
114957  agagtttgtgtaacaatgaattatttaggtcgttttttggttcctaagctgaacactgtt
115017  aactactcaattattaaattaaaaattaagtgtattctgaagacatttttttgtaaacag
115077  ctaaaagggcctgctttaatacttattaaatatttcaaatttattccaaatttatggaag
115137  agccaaatattttttaaacagtgagagtgttacaattgagtgtctgcattcagtttatca
115197  agtatgtggaatcagtttttatttgatttggtgttagcagatttcgaatttgtaattaaa
115257  gaaagaatttttaatttttattatagaaaattttttgggagctatcagaattttaaaagc
115317  aaatttcaatgcggagtaggtttattttttgttaaatgtgtagatgaaatattgatatgt
115377  tgtgaaaattatgaagagaaagattggataattggggtattatttgaaattttagtagat
115437  aaacagttaattatagattttttaagttctaaaattttactaggtcagcgcaatactaat
115497  tttctttatttaggttttgagattagaaatcatgacgtaagaagtagaaataagtacatt
115557  agactatgttgtgtaaaattttgaggtgatttagtgattcttccatgccaacgttcggta
115617  ttgggattgaaatcagagttaagaggggtgttatctaacgttaacgcctcggtttcttct
115677  ataatttaccgcttgaaccgtattgtttatcaatgaggtatgtattattcatttagtatt
115737  tcaagtgttttatgtctcttattggacagttttattcattttagggtttggagattttta
115797  aaacagaaattttctaaaataggtaaaacatatttagcagagcgatttttttttaccggg
115857  aatctgaaatatcaaacaaattttaagaaatggcattttcatgatgttttatctgaatca
115917  acgcagaatttattgtttaataataaaatttggtttatctgattagtgtctttaaggcaa
115977  ttttgttctataaaaagattttactatattcaataa
;     G-nad7-I4-orf511 ==> end
116013  atattagagttatttgttggaataaaatttttctattgattttacatattgtaatatgta
116073  aaaaaagatataatacttaatttgtagcagcaacgcgcataagctgaatactataagaat
116133  agtttgttcagttttatagggaaaagtttttgcaacaacgatttatcctaat
;     G-nad7-I4 ==> end
;     G-nad7-E5 ==> start
116185  AAGAGCGGGAAAAGTTATTAGAATTTTATGAGCGTGTTTCGGGAGCACGGATGCATGCTA
116245  ATTATATACGGCCTGGTGGTGTAAATAGGGATTTACCATTAGGATTTTTAGAAGATTTAT
116305  ATACATTTATTGTACAGTTTGGTTCACGAATTGATGAAATTGAAGAATTGTTAACGTATA
116365  ATCGTATTTGAAAGCAGCGATTAGTTGATATTGGTATTGTATCTAAAGAATTGGCTTTAG
116425  ATTGAGGATTTACTGGGGTTTTATTACGAGGATCTGGTGTAGTTTGGGATTTAAGAAAAA
116485  CGCAACCTTATGAAATTTATAATGAATTATTTTTTGATATTCCAGTTGGTAAAAATGGTG
116545  ATTGTTATGATGT
;     G-nad7-E5 ==> end
;     G-nad7-I5 ==> start ;; mfannot: no intron type identified
116558  gtggtgtaagaaacgtattatattagagtaaataggttaattaatgtttaaagtgtctgt
116618  aaaatgtttagcaactataatattaaaatattagtgttataaacaatcaattcgtaagat
116678  tgaaattgatattttttgatttaaaatatatataataaaaaattattaaattgatcatat
116738  ttaataaatgtattgtattactgcattagtttattaataagaaatttattaaagtgttaa
116798  ataaatttaattagataagtagtttagtgtaatcgttatggcatacatagtttacaaaat
116858  ttttattattacgttatttttgtaaaagaaaagagaattaattgattattcaaagtattt
116918  agggagatttatattaaagaccttttgattgtaaataggattttgtcttaagattaattt
116978  agttaaaaaaattatcctagtcgattgtagaatattttaatattaatattaaataagatt
117038  aattttggtagtataaattgggtttttatttattttttttacgtaatttgtatttctagt
117098  aaatactaagaataaaatggttagttgtatttatttttaattattaaggataatttgcca
117158  ttagttagaatattttgctaatagtttgttacgtagtttacaaattgtaaatgccttgta
117218  aatttattgatagtttagcttaatttgaacgcttttaaaaattttgctgagcacagttat
117278  tatattatattattttcgtaaagcttaatatattgggaaatatacgttaagtttgaattt
117338  gaaatcaatttaaagattttaaaataccg
;     G-nad7-I5 ==> end
;     G-nad7-E6 ==> start
117367  TTATCTAGTTCGTATTGGTGAAATGCGTCAAAGTTTAAACATATTAAATCAATGTATTAA
117427  TGAAATTCCGACTGGTTCAGTTAAATCAGATGATAAAAAATTGATGTCTCCAACAAGAAG
117487  TGAAATAAAACAATCAATGGAAGCTTTGATACATCATTTTAAATTATATAGTAGAGGGTT
117547  TGATGTTCCGCAGGGTGAAACATATGTTGGGGTTGAAGCGCCTAAGGGTGAATTT
;     G-nad7-E6 ==> end
;     G-nad7-I6 ==> start /group=II(derived) ;; mfannot: splice boundaries uncertain
117602  ttaagttaatatataattttacatatatttttgcattactatgatttagttaataatata
117662  ttattataggtttttatttttagtagcttattttccaattaagaataagtaaaaatcaag
117722  ttattgaacaatattaaatttgaggttatagtttatagtgtatttttatttaggcaatat
117782  atattgttgttaataagaaaaaagtttttacaaaattttgtaaataatgtataggtcaaa
117842  gtgatctaatttttgttcgagaaaaaattatatatctatttttttaattaaattcgtgga
117902  gtttacgtagtttaaaaagttgttgtatatttattgggcaaaaagtacatattaaatagt
117962  tagctatataaataaaatgtaaattttatttaaaagcaaaacgtatatatgtaaaaaatt
118022  atgtgatcttattagtataataatagaatattggaaattaaaggattttgttaaaaattt
118082  tccagttataagaaataacttaaaatgtaagttagattttaaatttaattaaaattttta
118142  ttaattattttagatgagaagaatggttaaaaaagttagataaacattattgtttcattt
118202  ctaattgtagttaaacaattataattatatttttttaattttaatttagttgttaaatta
118262  tgtataataagaaatggaattaagctgtatgtattgtgaattacatgtacagttttataa
118322  agggttttctactttttagtatagaaattctattttacgt
;     G-nad7-I6 ==> end
;     G-nad7-E7 ==> start
118362  GGAGTTTATTTAGTAGCTGATGGTTCAAATAAACCTTATAGATGCAAGATAAAAGCGCCA
118422  GGATTTGCGCATCTTCAAGGGTTAAATTTTATGGCTAAAGGACATATGATTGCGGACGTT
118482  GTTACTATTATTGGTACACAAGATATAGTTTTTTTATGATTTAAGTTTAGCGTTAATTTA
118542  TTTTATTTTTATTAA
;     G-nad7-E7 ==> end
;     G-nad7 ==> end
118557  AAAAATATTTAAAATTTTAATGAAAATATAATTGTTTAATATAGTGCATTGGAAGTATAT
118617  TTAAGTAAAATTTCTGAAAAAATTTATATTTAATCGTAGATGTTTTCAAAATTTATTATA
118677  GGATTTTAAGAAACAAATTTTATATTAATTTATTTTGTATGTAATAAAGTAAGAAGGTAC
118737  TAGTGTAAAATGCTGAATCGTAATGTGGGTAGGTATGGTATAGACTGTTTAACGTAAAAA
118797  TGTAAATTTTTTAAAAAAATTTTCTACCCATAAATTCTTATGATATAGAAATATTTTTAG
118857  AGTTTTTGTGTAATATGTAGAAAATATATAATTAAAATAGCAATAAAAAATGAAATGGAG
118917  TTTATTTCTATATTGTAATAGGCTACATTTTTTAAGTTTATGAATCGTACAGTAGATTAG
118977  CACTAAAAAAATTAGTTTTTTAAATTTACTATTAAATTAGGTAATGGTTATGATGAATTG
119037  GCTAAGATATTATATTAAAATAAATATTGATCAAAAGCTAGTTAAAGTAACCATTTAATA
119097  TTTTTTTGTTTATTTTTAGAATTTACTGCATCTATATGTATGTATTT
;; mfannot:     /group=II
119144  aagctgtatactaatctgattggtatgtgcagttttttaggagga
;; mfannot:
119189  TTTAGAAGATTCTATCTTTTGTGGTGAAGTAGATAGGTAGGTTTTGAAAAAATTTATGTT
119249  GTAGTATTAATATATTAGTTTATACAAATTTCAGTTATTTTTTGGATTGTTATTAGTTAT
;     G-nad4 ==> start
;     G-nad4-E1 ==> start
119309  ATGATTATTTTACCGATTTTAGTTTTGATTTGTGGAATTGTATGTATTAGTTTAATTTCT
119369  TCAGTGAGGTATATATATATTAAAAAGTTAGCTTTGTTTATTACAATTGCTGTGTTTTAT
119429  TTATCGCTATTGTTTTGAATATTTTATGTTAAGCAAAGTTTATTTTTTCAATTCATGTTT
119489  TATAGAGAATGGTTAGTGTTCATGAATATTGATATTATATTTGGTTTAGATGGTATATCA
119549  ATATTTTTTATTATTTTAACAACTTTTTTATTTCCTATATGTGTATTGTCAAGTTGAAAA
119609  ATAATTTTAGTAAATGTAAAGGAATTTTTTCTTTTACTTTTATTTTTAGAAAGTTTTTTA
119669  TTATTTATTTTTTCTACATTAGATTTAATATTATTTTATATTTTCTTCGAGAGTGTGCTG
119729  ATTCCTATG
;     G-nad4-E1 ==> end
;     G-nad4-I1 ==> start /group=II(derived) ;; mfannot: splice boundaries uncertain
119738  gtggtattataactttcttttctgaatatatttagaaaaaaataaatttcttattgatat
119798  tgttttttagctaatttgattagataaaatttaagtgattttgaagaatgcatttaagat
119858  ttttattaattactaaagcaataatttgtaataattgtaagtaatatttttataaaatac
119918  ttaagcaaaatttctgattagaagttgatataggattttaatgagagtaaatttaaagaa
119978  ttttcaatatagaaatattagaagggtgacttataaattactattaatttcaataatttt
120038  tagttgttggaaaagtcattgtttaataatgaatttataaaaatttaaattgattgggaa
120098  ttgtgtgggaattaatattaaaggaaaaaaattaaagtttttattagagctatataatag
120158  gaaactattttgtatggtttagaaacagaatttcttgtaataaactttattatttttaag
120218  tagtttagtgtaaaattttaattctagtttgt
;     G-nad4-I1 ==> end
;     G-nad4-E2 ==> start
120250  TTTTTAATTATAGGAATTTGAGGTTCGCGTGAGTGTAAAATTAAAGCTTCTTATTACTTT
120310  TTTATGTATACATTACTTGGATCATTGGTTGCTCTTATTGGTATATTAATAATTTTTTTT
120370  GAAACAGGCACTACGAATTTTTTTATTTTGTTAACTCATAAATTCAGCTTTGAACGGCAA
120430  TTGTTACTATGAATTATGTTGTTTATTTCATTTGCAGTTAAATTTCCAATAGTTCCTTTT
120490  CATATTTGGTTGCCAGAAGCTCATGTGGAAGCGCCTACGGTGGGATCTATTATTTTAGCG
120550  GGGGTTTTATTAAAATTAGGTATTTATGGTATGCTACGTTTTTCAATTTCTTTATTCCCT
120610  CAAGCCAGTAGTTATTTTACACCTTTTGTATATACAATTTGTATTATTTCCATCCTTTAT
120670  AGTTCGTTAACAACAATTCGTCAAGTGGATTTAAAACGTATAATAGCGTATTCTTCAGTT
120730  TCTCATATGAATTTTGGTTTGTTAGGTTTATTTTCTGGTACTTTACATGGTATTATTGGT
120790  GGTTTAGTTTTATCTATAAGTCACGGTTTTGTGACAAGTGGGTTATTTATTTGCATTGGT
120850  GTATTATATGATCGTTATCATACTCGTCTGCTAAAGTATTATAGCGGTATTGTGTTAGTA
120910  ATGCCTGTTTTTTCTGTTTTATTTTTATTTTTTTCGTTAAGTAATTTAGGTATGCCGGGT
120970  ACAAGTAGTTTTGTAGGTGAATTACTTATTTTGATAGGTACATTTAGCCAAAATAGTATT
121030  TCAGCTATTTTTGGATCGAGTGGTATTTTGCTTGGTACTTTATATTCAATTTGGTTATAT
121090  AATAGAGTGTGCTTTGGTAATTTGAAAATACAGGATAATGTATTAGTATATCTAGATATA
121150  TCAAAACGTGAATGTTTTTGTATTTTTCCATTAGTAGGTTTAGTGTTATTGTTAGGTTTA
121210  AATTCTAATTTATTTTTAGATTACTTACAGAGTGCAGGTTATATGTTACTTTTTGAATAG
;     G-nad4-E2 ==> end
;     G-nad4 ==> end
121270  TTTATTTTTTACTAGCAGTAAAAAAATTATATTTTTAATTATTATTACATTTATTAAAAT
121330  AAAAGTTATATGTTTAATATTAGAAAAATTTCGTTTTACGTAGTTTTTTATATCAGTTTA
121390  TGATAAAAATAATTTTGTCATAATAATACTTTATATTTTAGACTTGACGTTTTTTTTGTG
121450  TTTCTACATGTAATTTACATGTAAATTAAAGTGTGGTATTTTTTATAAAAAAGATGTATT
121510  TTTATATAAAATAGTCTTTAAAGTTGTTTATAAGTGTTATG
;     G-atp9 ==> start ;; mfannot: alternative ATG start pos 121548
121551  ATGATTTTAGAAAGTGCAAAAGTTATTGGTGCTGGGTTAGCAACGATTGGATTAGCTGGT
121611  GTAGGTTTGGGTATTGGGACAGTATTTGCGGCATTAATTACAGGAGTAGCTCGTAATCCA
121671  TCTTTAGTAAATCAGTTATTTACGTATGCGATGTTAGGGTTTGCTTTAACAGAAGCAATA
121731  GCTTTGTTTGTTTTAATGATTGCTTTTTTATTGCTTTTTGCTTTTTAG
;     G-atp9 ==> end
121779  TGTTTACGGCAAAAATATATTAAAGATTAATTTTTTATAATTCTATACAGAAACTGAAGG
121839  ATCTGTTTTTTGTATAGAAGATAGAGGATTGGGTACTTGAAATATTTA
;     G-trnD(guc) ==> start
121887  GGATTAGTAGCTTAATCGGGAAAGCTCCAAATT!GTC!ATTTTGGTAGATGTAGGTTCAA
121945  GTCCTATCTAATTCG
;     G-trnD(guc) ==> end
121960  TT
;     G-trnC(gca) ==> start
121962  GATTGGATAACATAACGGTAATGTGTTGAATT!GCA!AATTCATTTTATAGCGGTTCGAT
122020  TCCGCTTCCAATCT
;     G-trnC(gca) ==> end
122034  TGTTAATGTGATTGGTT
;     G-trnH(gug) ==> start
122051  GGCGGATATAGCTCAATGGTAGAGTATTAGTTT!GTG!GAGCTGATTGTTATGAGTTCAA
122109  ATCTCATTATCCGCC
;     G-trnH(gug) ==> end
122124  TATTTATTAAGATTTTTT
;     G-trnV(uac) ==> start
122142  TGGTAGTTAGCTCAAGTGGTAGAGCATCTCTTT!TAC!ACGGAGGGGGTTGTTGGTTCAA
122200  ATCCGATACTATCAA
;     G-trnV(uac) ==> end
122215  AAAATTTAAGTTTTTTACG
;     G-rnpB ==> start ;; mfannot: Approximate position
122234  AAGGAAAATCCTAATGTATTGTTATTTATACTGTAGTCAGTAAATGTAAATTTAAGAAGA
122294  CTTATTAGAAATAATTAAAATTTATTTTATGTTTTAAATTTATGTAATAAGAATATGCGT
122354  AAGCTTATCTATTTGTTGTTAAGTCTGCTGAAACAATAGAATATTTATTAATCATTAATT
122414  TAAGGTTTGGTTTTTTTACAGAATTAGGTTTAT
;     G-rnpB ==> end
122447  AAAAATTTTAGTTTACTTAATATAGATAATAAAAGTTGTATTTGGGTGTTTGAAATAGTT
122507  AAATGAAAATTTATTATATTTGGATTTGGAGTTTCTT
;;     rns ==> ;; mfannot: start of 5'
122544  TATAAGAAGGGTTTGATCCTGGCTCAGAATGAATGCTAGAAGTATACATAACACATGCAA
122604  GTTG
;;
122608  GACGAGTAATTATTTTACAAGTAGCGAACGGGTGCGTAATGTGTAAGAATTTGCCTTCTA
122668  ATTTGGGATAACCGGGTAATGCTGGCTAATACCAAATAATTTTTTTAAAAAGATTGAATC
122728  GTTAGGAGATAAGCTTACATAGGATTAGGTAGTTGGTAGAGTAATGGTTTACCAAGCCAA
122788  TGATCCTTAGCTAGTCTGGGAGGATGAATAGCCACATTGAAACTGAGACAAGGTTCAAAC
122848  TTTTACGGAGGGCAGCAGTGTGGAATATCGGACGTGCGGTTCATCTAATAATTTTATTTC
122908  GTAGTAAAATTACTTTGAAGTAAAAAAAAATTGTATATGTGTTACCTTTTTTAGGATGTA
122968  TTGATTTGTACAAACATCAGTACAATTAAATATGAGATTTATATAGAGAAATTTTAATAT
123028  AAATTGGTATTGTGTATAATAAAGGTTAAAAAATTATAATTAATAGTAATAAAATATATT
123088  TTATGTGGAATAGAGTTGTTGATAGCAAATCATTGAATGGGAAATACCATAATTTCATAT
123148  GCAAACTTAAATATGATTAGTAAAAGAGAATGTAATATAAAAATTAATGATAGATATATT
123208  TGTATGAAGTATGTAATGTAGGATTGTCGCAAGTTCTACATTTTTTTAAGCGTTAAGATA
123268  CTTCTGGTAGATAAATGAGTTCCAATTAATAAGTAAACACAAAAAGATGAATATTTTGTT
123328  TAATTCATATATATTAAAAGTTTAGTATGAATTTTAATAAAAAGGATATTCAATATATAG
123388  TTGATGAAATTAGTTTTCATTATAAAAATATATAAGTGAACATTGTAGTTTATTTAAGTA
123448  TTCAAAAATTAAAAAAAAGTACTTTAACTTATTTTTATTTAAAGTTTAGATAAAATATAA
123508  ATAATTTTGGTAAGAAGAACTTTAATATAAAATGCAATATTTTTGAATACGTAAATTTAA
123568  TTACTGAG
;; mfannot:     /group=II
123576  tagctgtataaaaggttacttttatgtacagttccgtaggggaagg
;; mfannot:
123622  TTAAATTTACAAATATAACTTTACTCTCTGACAATGAGCGCAAGCTTGATCCAGTAATAC
123682  TTTATGTGTGATGTGAAGAGTAGGAGACTATTTGTAAAGCACTATCGGTAAAAACGAAAT
123742  TGACTATATTTACATAAGAAG
;;     rns ==> ;; mfannot: corr to pos 485-571 of R.americana
123763  CTCCGGCAAATTTCGTGCCAGCCGCCGCGGTAATACGAAAGGAGCAGGTGTTATTCAGAT
123823  TAACTGGGCGTAAAGGGCATGTAGACGG
;;
123851  TTCATTATGTGTACTATGAGTTACAAAGTATAATTTTGGAAAGTAGTATACACAGCAGAA
123911  CTTGAGTTGGGTATAGGGTAGCAGAATCTTTAATGTAAAGGTGAAATTTGGTGAAATTAA
123971  AGAGAATACCAAGGCGAAAGCAGTTACCTATGACGAAAC
;;     rns ==> ;; mfannot: corr to pos 735-810 of R.americana
124010  TGACGTTGAGGTGCGAAGGCATGGGTAGCAAATAGGATTAGAGACCCTAGTAGTCCATGC
124070  AGTAAACGATGAATATT
;;
124087  AAATTTTGAAATAATGATTTTCAAAGTTAAAGCTAACGCGT
;;     rns ==> ;; mfannot: corr to pos 850-965 of R.americana
124128  CAAATATTCCGCCTGGGGAGTACAATCGCAAGATTGAAACTTAAAGGAATTGACGGGGAT
124188  CTAAACAAGCGGTGGAACATGTGGTTTAATCCGATGTGCGTTTCGGTAAGAGTGAG
;;
124244  TAGGAGGCTCATTGTCTTATTCAGTTTTTATAGTTAAGCTGATTTTTTGGTATATATATA
124304  TAGATGTAAATTCTGTATCTTTTATGTATAGATAGTTCACCAGAAGCTAAATTTCGGTTT
124364  AGTTATCCCACCACAAGAGAATAAGTAGGTAGTATTTGTGTGGTAAGCAGGGACTTTAAT
124424  ATTTAATGTATGCGGTATATTCAAAATACAGTAAAGTGTGAACATAGATTATTAGGAGAG
124484  AAAATACGTACTATTATTGTAATAGTGAAATTCGTCATAAAAACTTTATTTAGAGATTTT
124544  TTAAATCGAAAAGTTTAAAGATTTGTATTGATTATTGTGTAAAGTTGGATTACGCAACAT
124604  GTATAATAACTTTTGGCGTTTATAATAGCTCCAACAATAATTTTAATTGGAATGTATACC
124664  AAAACGAAATTTTTTCTTCATAGTCTATTCTTTAATTTCTATGGTATTCTACAAGGGGTA
124724  TGAAGAATTTAGGATAATATAGAATATTAATAAAACCTGTTGTTTTGGAAAAATTAGGTA
124784  AAATTAAATTATATTTACAAAAATTTTTTATTTTCTGATTTTAGAATTT
;     G-orf148 ==> start
124833  ATGTTTTTGTTAAG
;; mfannot:     /group=II
124847  tagctgtatgaattggaaaattcatgtatggtttcgaataggcgg
;; mfannot:
124892  TCTAAGTTTTTTAGAATATAGTATCGACCTTACCACTACGCGTAAAATCTTACCAGTTTT
124952  TGAATATTTTA
;;     rns ==> ;; mfannot: corr to pos 1014-1044 of R.americana
124963  TACAGGTGTTGCATGGCTGTCGTCAGTTCGTGTTGTGAAG
;;
125003  TGTTTGGTTTAGTCCCTATAACGAACGCAATCCCTATCTCTTATTGCTAAAATACTTCTG
125063  CAAAAGTATTAAGAACTTAGGAGAATCGCTAATAACAAATAAGCTGAAAGTGGGG
;;     rns ==> ;; mfannot: corr to pos 1190-1252 of R.americana
125118  GTGACGCCAAGTCGTCATGGCCCTTATAGACTGGGCTACACACGTGTTACAATAATTATT
125178  ACA
;;
125181  ATGAGAAGCAATAATGTAAGTTGGAGCAAAACTCTAAAGGTAATTTTAGTT
;;     rns ==> ;; mfannot: corr to pos 1305-1411 of R.americana
125232  CAGATTATTCTCTGTAACTCGAGAATATGAAGTTGAAATCGCAAGTAA
;     G-orf148 ==> end
125280  TCGCAGATTAGTATGCTGCGGTGAATATGTTCTTAGATCTTGTACACACCGCCCGTCAC
;;
125339  ACCCTGGGAATCGGTTTTATTGTAAACAGATTGTATAACTTAAAGGAGATTGTAAAATAA
125399  ATTTAGGAGTTCGTCTGTTAGATTAGAAT
;;
125428  CGGTGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGTTGTAGGGGAACCTGCAGCTGGAAGTAAG
125488  ATATA
;;     rns ==> ;; mfannot: end of 3'
125493  AATAACACTCATTTATTATTTTGTATGTATTTTATCG
;     G-rrn5 ==> start ;; mfannot: complete
125530  GATATTCTAATAATATATATTGATACTGGATCCCATTTCGAATTCCGGAGTAAAACATAT
125590  ATATTTCATATATAGCATAAATGTTGTGAAACGTGATTATGGTATT
;     G-rrn5 ==> end
125636  TAATGTAG
;     G-trnF(gaa) ==> start
125644  GTTTAGATAGCTCAGCGGTAGAGTAAAACACT!GAA!ACTGTTTGTGTCGCTGGTTCAAA
125702  TCCAGTTCTAAACA
;     G-trnF(gaa) ==> end
125716  AAAATTGCTATAAAAAAG
;     G-trnK(uuu) ==> start
125734  GAATGTGTAGCTCAAGTGGTAGAGCAGTAGGCT!TTT!AACTTAATGGTTCCGAGTTCAA
125792  GTCTCGGTACATTCA
;     G-trnK(uuu) ==> end
125807  ATTGTATAGGGTTTTAACTCAAATATTTTTTGTGATATGAAACGGCAAAATAAATTTAAC
125867  AGTTTGAAGTTTATGTATGTATACACTAATGGTTCTATTTTAATTTCTAAAGATTTTTGT
125927  AAATATAATTTTTTATTAGGTGTGGATATTTTTAACTCAAAGCATTGGTTACGTGTAAGA
125987  TCAATATTTTTCGAAGGTAAATCAGTGATAAAATTTAAATCAAAATTTTCAAAAATTGGG
126047  AATATCTAAATTATATAGTAATAAATTCATATAAAATAGAAATATC
;     G-trnT(ugu) ==> start
126093  GTATCGTTAGCTTAATTGGTAGAGCATTGATTT!TGT!AGTTCAGAGGTTGTGGGTCCGA
126151  GTCCCATGCGATACA
;     G-trnT(ugu) ==> end
126166  ATTTTTTGGGTTAT
;     G-trnM(cau)_1 ==> start
126180  TGTAGTATTGAGTAATTGGTAACTCACTAGATT!CAT!GCTCTAGGAATATTGGTTCAAG
126238  TCCAATTACTACAA
;     G-trnM(cau)_1 ==> end
126252  ATTTAGACTAGAATTGAAGAAGAGAGTAATAA
;     G-trnM(cau)_2 ==> start
126284  GGGTTTATAGCTTAATGGTTAAAGCAGACTACT!CAT!AATGGTTTTATTGTAGGTTCGA
126342  ATCCTACTAGACCCA
;     G-trnM(cau)_2 ==> end
126357  TATATGG
;     G-trnA(ugc) ==> start
126364  GGGGATGTAGCTTAATGGAAAAGTTCATACTT!TGC!AAGTATGCAGATATCGGTTCGAA
126422  TCCGGTTGTCTCCA
;     G-trnA(ugc) ==> end
126436  AAGTATTTAGAGTGAGT
;     G-trnR(ucg) ==> start
126453  GCGTCTATAGCTTAATTGGAAAAGTACCGAACT!TCG!GATTCGTGTTATGAGAGTTCAA
126511  ATCTTTCTAGACGTA
;     G-trnR(ucg) ==> end
126526  TA
;     G-trnI(gau) ==> start
126528  AGGCTTATAACTCAATTGGTAGAGTACGCAAGT!GAT!ATTTGTGGAGTTGGTGGTTCAA
126586  GTCCACTTAGGCCTA
;     G-trnI(gau) ==> end
126601  ACATTTTTTAATAAAGATTTATCGTATG
;     G-trnL(uag) ==> start
126629  GCCTTTGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAAACT!TAG!AATTTAGTTTTTTCGGATGTA
126687  AGAGTTCGAGTCTCTTCAAAGGTA
;     G-trnL(uag) ==> end
126711  TAGAAATTGAAAA
;     G-trnN(guu) ==> start
126724  TTCCATCTAGCTTAATAGGTAAAGCAATTCACT!GTT!AATGAATGGAGTATAGGTTCGA
126782  GTCCTATGATGGAAG
;     G-trnN(guu) ==> end
;     G-trnY(gua) ==> start
126797  GAAGGAGTGGCTGAGTGGTTTAAGGCGGTAAACT!GTA!ACTTTACTAATGTTATCATTA
126855  TCATAGGTTCGAATCCTATCTCCCTCA
;     G-trnY(gua) ==> end
126882  AAAGATATTAATGAAGTTAAAAGAA
;     G-trnE(uuc) ==> start
126907  GTTCCTTTCGTCTAGTGATTAGGACATTGCCTT!TTC!AGGGTGAGAACGTGGGTTTAAT
126965  TCCCACAAGGAATA
;     G-trnE(uuc) ==> end
126979  ATGTATTGTTATGAATATATTAT
;     G-trnQ(uug) ==> start
127002  TGGGATATAGCCAAATGGTAAGGCATTGGTTT!TTG!ACATCATGAGTATAGGTTCGATT
127060  CCTATTATCCCAA
;     G-trnQ(uug) ==> end
127073  AGTTATTCATTTGAAAATCGTATA
;     G-trnG(ucc) ==> start
127097  GCGAATATAAATTAATGGTAAATTATTTGTCT!TCC!AAACAGATTTTGAGAGTTCGAGT
127155  CTCTCTATTCGCA
;     G-trnG(ucc) ==> end
127168  AT
;;     rnl ==> ;; mfannot: 5' +/- 50 nt
127170  AATATATAACTTAATATTTGCATGTAAAGTATATTTAATGAATACCTTGGTATAACAAAT
127230  GGTAAGGACGTTTTGAAATGCGAAAAGTCGTGGTGTTAAGTAGAAGATTGTTAAACGCGA
127290  ATTTCCTTGCGAAGAAATTTATTCTTATAAGAATTATGAAAAAGAATTTAGGGAATTGAA
127350  ACATCTTAGTACCTAGAGAAAAGAAATCAATCGAGATTCCGAAAGTAGTGGTGAGCGATT
127410  TCGGATATAGGTTAATTAAATTAGTTTTTATACACTAGGAAATATCTTGAAAGGTATACC
127470  GTAGAAAGTTGTAGTCTTGTTATTTGGTGTATAGAGATTTATATATTTAAAATATTTAAA
127530  ACGATTTTCGTGTAGAATTGTTTGAAAATGGGAGGCCCACCTTCCAAACCTAAATATTTG
127590  TTATAACCGATAGTGTAT
;;
127608  AAGTACCGTGAGGGAAAGGTGAAAGAAAACCCATTAGGGAGTGAAAAGAAGTTGAAATTA
127668  AATATAAAGAAATAATTTAATAATGATTTTATTTTATAATTATTATAAATGTACCTTTTG
127728  TATAAGTGTTACAAATAAAGTTATTGGGAGAAAGAAGTAGTCGCTGCATTAGATAGGAAA
127788  TAGAAAAAAAACGTTCATATTGCATTGTATTAATAAATAGTAAATAAAAGAATAAGTTAT
127848  TAATTAAGAATAGGCTTCCATAGATAAAAGGTTTTAACTACTGAAGTATTAAAATTCTTA
127908  TACGGTTAAATTAAATTGTTAAAAAATTGGGAGTAAACTTTGATTCTAATTTACTAAAAA
127968  CCTCTTAATAAATATTTGGGTTTATTCATAATTATATACCTAATTATGAATTAATGAAGA
128028  GTATTTAGATAATTTTTTAAATAAATACCAAATTAAAGTTTAATTATTTATATTAATTAA
128088  TTTGAAATTGGCG
;; mfannot:     /group=II
128101  gagcttcatgttatgaaatagcatgtgtagttttaggtggg
;; mfannot:
128142  GAAAATTTTAATTTTCTATCATAATTGGGTCAGCAAGTTAATAAGGATAGTTTGCTTAAC
128202  TTTGGTGATAAAAGGGAGGCGTAGCGAAAGCGAGTTTTAAAAAAGCGAAAATTGGATCTT
128262  TCTTATTAAACCCGAAGCCAAGTGATCTAACCATGATCAAGTTGATATTACTGTGATAGG
128322  TAATTGAGGACTGAACCCGTATATGTGGCAAAATATTGGGATGAATTGTGGTTTGGAGTG
128382  AAAGGCTAATCAAACTTGGCAATAGCTGGTTTTCTGCGAAATCTATTTGTGTGCTTAGTG
128442  CGAATACGCTTATAATGTAAAAGAATTGTAATAATAATATTAATGTAAAAAATATAGATA
128502  AATTTAATTTATTAAATTTTATATAATATGAATTTCGTCATATTTTTGGTTTTAAACTAG
128562  AAAAAATATATGAGAGTAAATTCTAGTATAAAAATAATGAATTTTTTAATTGACTTTAAA
128622  GTTTTTAAACAGAATATTTATTTTACAAATTGTTAAAAATTATTTGTGAATAATATAAAA
128682  TAAACTATGTTTGTTAATTGTTACCGTAATTCGCGATTTTACAAAGTTAAGAAGTTTATA
128742  GTATAAAAAAAATATATTTGTTTGTATAAGATAGATATGGAAAATTTAAATTAGTTTTTT
128802  CGGTAAAAAACATAGATTCATTTAATAATAAACATAAGAGATATATAAACTAAGAGTGTT
128862  TTTAAAATAAATTTGAAAGAAATTTATAGAAAAATTACACAACGGATCAAATTCATATTT
128922  TTTCTTTAAAGATTTATAATTAATTTGCGTTTTAAATATAGCATTAAATAATGTATATAC
128982  TATGTATGGTTTTTGTTATGTAAAAATATTTTGAAATAAGGGAGGTTTTTACAAATTGCG
129042  TAATTAAAAATATAATCATACTATACGTTTGTTAATTTTATATTTAAAGTGAGAAGCTAG
129102  GTAATAATAAATTATTATGTGTAGTTTTGAAGTAAAGTTTTCTTAATAGAAATCGATTAT
129162  AACAGGTAGAGTGTTATATAGTTTATTTTACGGGTAGAGCTCTAGTTATTTGATGGGAGT
129222  GTAGCAGCTTTACTGAGAATAATTAAACTTCGAATAGTAAATTTTAAGTTATAATAAACA
129282  GACTTTTGGCGATAAGGTCGAAGGTCAAGAGGGAAACAGCCCAGATTACATGATAAGGTC
129342  TTAAAATAATTTTTTGAGTGAAAAAGGAAAATTTAGTACTTAAACAATTAAGAGGTAGGC
129402  TTGGAAGCAGCCATTCTTTAAAGAAATCGTATTAGATCATTAGTTATTCTAGTTTAAATT
129462  TTTCTAAAATGTATAGAGGCTAAAAAATTTACCGAAGCAGTAAATAAGAAATAATTTCTT
129522  ATGGTAGCAGAACGTTCCGTAGTTTTTTGAAGGAAAATTGTGAAATTTTTTGCAGAAATC
129582  GGAAGTGAGGATGCTGATATGAGTAACGAAAAATATAGTAATAATCTATATCGCTGTAAG
129642  TTTAAGGTTTTCAAAGTATGGGTTAACTACTTTGAGTAACACAGTATCTAAGATAAAAAA
129702  AGGGTGAAGACTTAAGTTGATGAAGAAAGAAGTTTATATTCTTCAGTAATTTTAGAAAAT
129762  TAATAGTTATTGTGCGAATTTGGTTTAATTATCTTATCAAGTTTCTCATAAGCTATTCGA
129822  GAAAAATTCTAAATATTAAAACTGTATTTAAACCGACACTGGTGAACTGGTACGATTATG
129882  TACTAAAGCGATTGAAAGAATAGTATTGAAGGAACTCGGCAAAATTGTTCTGTGACTTCG
129942  GTATAAAGAACACCAATCATATTTATATAGGTTTATATTTTGGTTGGTAGCAGAAATAGG
130002  GGGTAGCGACTGTTTAATAAAAAGTATGATTTGTTATTATGATTCTGTTTACTAATGGTT
130062  AATTAACATTTTTTTCTTAATACTGTAATAAAAAAATTATGTTAAATTTAGAATTTACAC
130122  CATTAACTTGCGATGCAGGCATTTTATATAAGAATAATTTAAATATATGTATATTTTAGG
130182  CGTCTAGAAGGCAGCGTATTTTATGAAAAAAATAGAAATATTAGGTTATATAAATTAAGA
130242  TGAGAAAATAGCGTAATTATTCTTTTTAGTAATTACGTAAGAATTGTATAATTATTTTTA
130302  CAATTTTTGTAAGGCGTAGAGAATAATTTTAACTACAAAATGAGATGCATTATTCATAAT
130362  AAATAAAGTAGTTTTTTAATATATTGTAAGTAGTTGAACAAAGTTGTTTTAGAATTTTGT
130422  TATATATATAGTTAAAAAATTAAAGAAAATATAAAAATACGATTAAATTTTTAATGTAAT
130482  TTATATAATTAGTGTTGATTAAATACTCCCCTAGTATTATAATCTTTTTAGATATACAAT
130542  AGGGAGTTATTAACATTT
;; mfannot:     /group=II(derived)
130560  gagctgtatataatgaaaattatatgtacagtttttatagggggaa
;; mfannot:
130606  AATTTGAAAAAATTTACCTATCTAAATCACAGGACTCTGCTAAATTGTAAAATGATGTAT
130666  AGGGTCTGACACCTGCCCAGTGCTGTAAAGTTAAAAATTAGTTGTTTATGCTTCTAATTT
130726  AATCTCCAGTAAACGGCGGCTGTAACTCTGACGGTCCGTGTGTTTCCGTAATTAAAATAT
130786  AGTTTAATTAAAATTATATTGAATAAGAATTTATAGTGTGGATTTAGAAAAATTATTTTG
130846  GTATATAAAATGCAAGAAAATTATTAATTTTGATCAAAGATGGTTTTATACTTAAGTAAT
130906  TTATAAATTAGAAAAAAATAGATCATTGTTTGAAAATAAAGAACGACTCCAGTTAAGTTT
130966  CGAATAACAGAGAGTTATACTTTAAAAAATTTATAAATATAGAAAATATAGGGTTTGAAA
131026  GTTTTTTATTAAAAATTGTGATGTTTTTAAATTGGACTAATTTAAATATGTTTTATAAAG
131086  ACAATTCGGAATAAAAGTCGAATCTATTTTTTGTCTAAACACTGTAAAAACGGAAATAAC
131146  ATTTATATTTATTTATTTTTTAATATAAGTATATTATCAATTGAAAGGTAATAAAGATTA
131206  AAATAGTAAGTATAAACGGAAAGATACTATAAAAATGCTTTTAATTTTTTAAACATGTTC
131266  ATAGTATTAACTTAATAAAAATTTGAATGTTTTTAGAATGGTTAATAGAAGTTGTATGGT
131326  AATAATTACCAGGTACAATTTTAATTAGCAAATTATTATTAATGATTTGACTATAATTAA
131386  GGTAGCGAAATTCCTTGTCTAGTAATTTTAGACCTGCATGAATGGTGTAACGACTTCCCT
131446  ACTGTCTCCAATACTATTTCAGTGAAATTAGAATATCCGTGAAGATACGGATTATTATAT
131506  GATTAGACGGAAAGACCCTATGCACCTTTACTAGATTTTTATATTGTTACAAAGACTAAA
131566  TTGTGTAGAATAGGTGGGATGTTTTTGATCTTTTTTAAAAAGGAAAACGTAAGTGAAATA
131626  CCACTCGTTTTAGTTCTTTGAACTTACTTATTTTCAATAAGGATAGTGTATATTTGCTAG
131686  TTTGGCTGGGGCGGCCGCTTCCTAAAGAGTAACGGAGGTGTACAAAGGTAAATTTGATTT
131746  AATGTTTATTAAATTTTAAGTGTAATGGCAAAATTTGCTTGACTGCGAGACTAACAAGTC
131806  AAGCAGGGACGTAAGTCGGTCATAATGATCCGGTAATTCTGCGTGGTAAGGTTATCGCTC
131866  AACGGATAAAAGGTACGCTAGGGATAACAGGCTTATGACCCTCGAGAGTTCTTATCGGCG
131926  GGGTCGTTTGGCACCTCGATGTCGAGTGTAATTCGCTAATTATCATATATAGGAAATAAT
131986  AATATTATTTTTTATATTGATGTAATTTTTGTTATGTTTAATGTATTTATTTATTAAATT
132046  AATTTTTGGTAAACTTTTAGATTCTATCAAATAATTTTTTCCAAGCAATACATTATAATT
132106  TACTTAGAGTTGAGTTAGGTCTTATTTATGAAGAATATTTCGTTATGAGGTGTATATAAT
132166  CCGAAAGGGTAGTATGAATTTTTTTATATACATAAACTGCTATTATATTGGCGTTAATAG
132226  GTTTATAAATTATAATTGGATCGGAATAGAGTAAACAAAACTAAGTATTATAATAGCAAA
132286  AGAGGTGAATAGACGTTGAATTATATGTTAAAATGTAATTCGCGAAAATGGATTCGATAA
132346  TATATGTTTCTATTTATGGAAATAGAAGTTACTAGTAATATCGAAAGAAAATTGAAAATT
132406  TTTTTGTTTTACGAAGCATAAAGTTTTGGATATTGATTTA
;; mfannot:     /group=II(derived)
132446  aagctatatagtaagaaattactacgtatagtttggcagtagcagta
;; mfannot:
132493  TGATGTTTATATGATATTGACT
;;
132515  ATAACCTTTTCACATCCTGGAGCTGAAGAAGGTTCCAAGGGTTCGGTTGTTCGCCGATTA
132575  AAGTGGAACATGAGTTGGGTTTAGAACGTCGTGAGACAGTTTGGTCCCTATCTGTCATAT
132635  ACGTTTTAAAACTGAAAAAATTTGTATCTAGTACGAGAGGATCGATATGAATTGGCCGCT
132695  GGTAAATCAATTATTTTGATATAAAGTATCGTTGAGACGCTACGCCAATTATATATAACT
132755  GCTGAAGGCATATCAAGCAGGAAGATGATTTTAAGAAGAGTTTTAATTAGTTGTTGAAAC
132815  AGTTAGTTGGTTATAGATAATGACTTTGATAGGCTACTAGATGTACATAGTGTAAATTAT
132875  TCAGTCTGGAGTACTAAATAACTAAT
;;     rnl ==> ;; mfannot: 3' -20/+180
132901  ATATAATTTATATATACAATTAT
;     G-trnS(gcu) ==> start
132924  GGAAAGGTGACTGAGGGGTTGAAGGTGATGGTTT!GCT!AAATCATTATATAAAGTTTTA
132982  TATCGTGGGTTCGAATCCCATTCTTTCCA
;     G-trnS(gcu) ==> end
133011  ATTTAAAATATA
;     G-trnL(uaa) ==> start
133023  GCTTACTTGGTGGAATTGGTAGACACGATTGACT!TAA!AATCAATTCTTTAAGAGGTAT
133081  CGGTTCAATTCCGATAGTAAGTA
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133104  AATTAATTTTAAAATATAAACAAAGGA
;     G-trnS(uga) ==> start
133131  GGGCGTATGGCTGAGTGGTTTAAAGCGTTAGTCT!TGA!ACACTAATATGTAAAATTTTT
133189  ATATCGTGGGTTCGAATCCTGCTACGTCTA
;     G-trnS(uga) ==> end
133219  AGGGT
